More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0860 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0860  putative aminotransferase  100 
 
 		 323 aa  648    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1371  putative aminotransferase  45.02 
 
 		 344 aa  269  4e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  27.33 
 
 		 864 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.1 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.51 
 
 		 361 aa  95.9  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.19 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  24.2 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  26.83 
 
 		 352 aa  92.8  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  23.87 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  24.92 
 
 		 863 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  23.01 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  24.2 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  24.2 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.24 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.86 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.5 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.1 
 
 		 357 aa  89.4  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  28.13 
 
 		 364 aa  89.4  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  30.04 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  24.29 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  26.67 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.58 
 
 		 375 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.06 
 
 		 360 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  23.82 
 
 		 863 aa  85.9  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  29.29 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.21 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  24.13 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  28.15 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  26.74 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  21.45 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  27.21 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  28.72 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  24.86 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  22.7 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  26.59 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0787  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.2 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.226341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  26.3 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.46 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  24.42 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  26.65 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  27.5 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.53 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.01 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.52 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  25.27 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.4 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  25.73 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  26.1 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  27.24 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  27.24 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  24.04 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  25.99 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  27.24 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2837  aminotransferase class I and II  22.97 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  25.28 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  24.38 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  27.17 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  27.24 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  22.91 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  27.24 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.57 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  25.14 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  28.21 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  29.83 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.25 
 
 		 496 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  27.57 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  22.35 
 
 		 858 aa  76.3  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  22.32 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  25.87 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  25.88 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  25.34 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  25.87 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  25.88 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  27.07 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  23.44 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  27.62 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  23.5 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1900  histidinol-phosphate aminotransferase  23.85 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  29.58 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  23.62 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  25.51 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  21.99 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  26.76 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  25.84 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  22.12 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4029  aminotransferase  27.62 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  24.89 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  27.84 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  32.89 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  25.51 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  29.41 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  25.5 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  24.93 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  27.97 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  25.43 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.88 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  25.18 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  25.11 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  24.63 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  26.25 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>