More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1369 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1369  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
308 aa  618  1e-176  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.481739  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0290  aminotransferase class I and II  91.09 
 
 
304 aa  557  1e-157  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.626117  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1536  aminotransferase  61.18 
 
 
306 aa  340  1e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0541344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.58 
 
 
360 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  33.71 
 
 
346 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  25.56 
 
 
354 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  26.32 
 
 
364 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  25.97 
 
 
354 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.96 
 
 
375 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  23.1 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  30.42 
 
 
364 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  28.9 
 
 
364 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  30.04 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.5 
 
 
370 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.71 
 
 
379 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.12 
 
 
366 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  30.04 
 
 
364 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  28.9 
 
 
364 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  28.75 
 
 
346 aa  91.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2182  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.68 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.243931  hitchhiker  0.000290112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  28.28 
 
 
356 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.37 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  29.3 
 
 
361 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  29.69 
 
 
378 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 
360 aa  89.7  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  32.24 
 
 
357 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.05 
 
 
399 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.01 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.69 
 
 
366 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  30.03 
 
 
349 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1426  aminotransferase class I and II  30.2 
 
 
326 aa  86.3  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  29.17 
 
 
352 aa  85.9  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  31.27 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  26.38 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  25.67 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.49 
 
 
361 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.65 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.64 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.47 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  29.04 
 
 
852 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.02 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  26.63 
 
 
630 aa  78.2  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  26.09 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.28 
 
 
362 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  27.11 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1235  threonine-phosphate decarboxylase  34.67 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0882748  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  24.78 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  24.19 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  24.84 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.14 
 
 
496 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.28 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  33.91 
 
 
863 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  26.78 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  26.67 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  24.78 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  24.09 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.61 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.4 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.65 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.45 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.87 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  28.99 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1275  threonine-phosphate decarboxylase  29.19 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334025  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  26.25 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1457  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.36 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  30.77 
 
 
863 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4043  threonine-phosphate decarboxylase  29.19 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  30 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.24 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  31.02 
 
 
360 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  28.45 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  24.78 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  27.03 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1744  aminotransferase class I and II  31.6 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1676  threonine-phosphate decarboxylase  31.76 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  27.08 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  25.08 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2610  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.63591e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  34.97 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.96 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  30.91 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  24.84 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33090  Cobalamin biosynthesis CobC protein  30.46 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0139  aminotransferase  42.5 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1712  cobalamin biosynthesis protein CobC  33.79 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3677  threonine-phosphate decarboxylase  33.1 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405143  normal  0.0339835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  33.33 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1295  cobC protein  49.35 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  21.69 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1258  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  49.35 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.461577  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3732  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.63 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.96 
 
 
498 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1371  putative aminotransferase  25.07 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  27.51 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0726  histidinol phosphate aminotransferase  29.52 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  24.91 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  26.83 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  30.23 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02151  aminotransferases class-I  22.49 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  27.75 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>