More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0914 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0914  L-aspartate aminotransferase  100 
 
 
332 aa  645    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2040  aminotransferase, class I and II  74.09 
 
 
327 aa  473  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0810  aminotransferase class I and II  72.29 
 
 
332 aa  451  1e-125  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1791  aminotransferase, class I and II  72.95 
 
 
338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1417  aminotransferase, class I and II  34.94 
 
 
406 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  25.66 
 
 
456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  31.2 
 
 
398 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  31.93 
 
 
403 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  29 
 
 
374 aa  115  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2538  aminotransferase class I and II  30.4 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.408129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  27.57 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  31.12 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  28.41 
 
 
380 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  32.68 
 
 
400 aa  112  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  28.28 
 
 
377 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  27.7 
 
 
380 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  28.28 
 
 
377 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  27.71 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  30.23 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07271  aminotransferases class-I  23.18 
 
 
392 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.232753  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  27.71 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07291  aminotransferases class-I  23.46 
 
 
392 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.122313  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  28.49 
 
 
393 aa  109  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30380  aminotransferase  27.85 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270512  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  26.97 
 
 
394 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  29.81 
 
 
399 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0674  L-aspartate aminotransferase  23.18 
 
 
392 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2962  aminotransferase class I and II  29.68 
 
 
373 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.293014  normal  0.586653 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  28.32 
 
 
386 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  27.35 
 
 
379 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  27.13 
 
 
390 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  25.79 
 
 
387 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1119  aminotransferase class I and II  32.26 
 
 
368 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  34.13 
 
 
380 aa  106  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  28.65 
 
 
417 aa  105  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  29.14 
 
 
393 aa  105  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  27.62 
 
 
392 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  27.49 
 
 
382 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  25.63 
 
 
392 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  28.65 
 
 
392 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  27.62 
 
 
392 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  26.45 
 
 
400 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  27.68 
 
 
382 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  27.73 
 
 
373 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  29.53 
 
 
381 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  28.12 
 
 
401 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  27.93 
 
 
393 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  25 
 
 
394 aa  103  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  29.44 
 
 
405 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  23.46 
 
 
375 aa  103  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  26.84 
 
 
392 aa  102  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  28.13 
 
 
367 aa  102  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  26.67 
 
 
388 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2619  aminotransferase class I and II  32.1 
 
 
366 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  27.17 
 
 
399 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  25.77 
 
 
390 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  29.82 
 
 
387 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  26.65 
 
 
397 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  24.24 
 
 
400 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  25.71 
 
 
393 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  31.15 
 
 
389 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  28.35 
 
 
373 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  22.75 
 
 
393 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  28.32 
 
 
382 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  27.48 
 
 
382 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1766  aminotransferase class I and II  29.51 
 
 
377 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  26.42 
 
 
402 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  27.95 
 
 
375 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  26.63 
 
 
373 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0959  aminotransferase class I and II  28.49 
 
 
395 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1382  aminotransferase  26.92 
 
 
397 aa  100  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  27.2 
 
 
400 aa  99.8  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  28.82 
 
 
389 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  26.13 
 
 
389 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  25.93 
 
 
408 aa  99.4  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  31.21 
 
 
385 aa  99  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  28.12 
 
 
384 aa  99.4  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  27.11 
 
 
402 aa  99  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  26.21 
 
 
392 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  28.17 
 
 
390 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  28.57 
 
 
382 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  26.11 
 
 
397 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  25.27 
 
 
400 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  27.83 
 
 
383 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  32.73 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  24.16 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  26.29 
 
 
395 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  25.82 
 
 
400 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  25.82 
 
 
400 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  25.64 
 
 
391 aa  97.8  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  26.5 
 
 
391 aa  97.4  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  25.69 
 
 
400 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  29.91 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  25.44 
 
 
379 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  27.57 
 
 
414 aa  96.7  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  30.5 
 
 
388 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  27.75 
 
 
382 aa  96.3  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  24.23 
 
 
395 aa  96.3  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1791  aminotransferase class I and II  31.36 
 
 
404 aa  96.3  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.117721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.17 
 
 
385 aa  96.7  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>