More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29124 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_29124  predicted protein  100 
 
 
583 aa  1183    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06374  ATP-dependent RNA helicase dbp9 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZA6]  35.29 
 
 
610 aa  323  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84074  ATP-dependent RNA helicase DBP9 (DEAD-box protein 9)  33.02 
 
 
581 aa  298  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.114651  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25549  predicted protein  37.55 
 
 
512 aa  283  4.0000000000000003e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02050  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 
627 aa  254  3e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  31.54 
 
 
516 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14032  predicted protein  32.33 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02650  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 
808 aa  173  7.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.12 
 
 
630 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.79 
 
 
626 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.55 
 
 
627 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.51 
 
 
472 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  30.79 
 
 
622 aa  170  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  30.83 
 
 
503 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.76 
 
 
432 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.9 
 
 
626 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  31.31 
 
 
500 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.02 
 
 
448 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00759671  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3974  putative ATP-dependent RNA helicase  29.88 
 
 
478 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1418  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.81 
 
 
401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0501  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.43 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1273  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.99 
 
 
456 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163925 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001255  ATP-dependent RNA helicase  30.84 
 
 
443 aa  164  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.02 
 
 
465 aa  163  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.509668  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  29.31 
 
 
398 aa  163  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.83 
 
 
628 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1657  DEAD/DEAH box helicase  31.64 
 
 
483 aa  162  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0121598  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1537  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.22 
 
 
449 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.713304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  30.02 
 
 
639 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41606  predicted protein  29 
 
 
755 aa  161  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.323573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  30.39 
 
 
557 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.41 
 
 
522 aa  161  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  29.93 
 
 
635 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.38 
 
 
629 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  30.38 
 
 
629 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  29 
 
 
710 aa  160  7e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05125  ATP-dependent RNA helicase  29.98 
 
 
447 aa  160  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1190  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.96 
 
 
462 aa  160  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1022  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.77 
 
 
435 aa  159  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0284952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1660  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 
451 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0076  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.86 
 
 
452 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000113664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.39 
 
 
514 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 
498 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2698  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.7 
 
 
451 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  hitchhiker  0.0000852127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.45 
 
 
599 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2838  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.88 
 
 
449 aa  159  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  30.81 
 
 
527 aa  159  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1682  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 
451 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.747215  normal  0.719236 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1645  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 
451 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.27 
 
 
515 aa  159  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.27 
 
 
515 aa  159  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 
482 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2321  DEAD/DEAH box helicase-like  30.98 
 
 
487 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3053  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.47 
 
 
447 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643926  normal  0.011472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3068  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.73 
 
 
433 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0919  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.27 
 
 
432 aa  159  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000178347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2624  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.3 
 
 
448 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394652  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.44 
 
 
504 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1422  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  29.83 
 
 
427 aa  158  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.219008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.66 
 
 
527 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1648  DEAD/DEAH box helicase-like  28.57 
 
 
607 aa  157  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.58 
 
 
427 aa  157  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.98 
 
 
577 aa  157  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.32 
 
 
427 aa  157  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0112372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.98 
 
 
578 aa  157  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.15 
 
 
519 aa  157  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.56 
 
 
454 aa  157  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.15 
 
 
519 aa  157  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2444  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 
449 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2514  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 
449 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2606  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 
449 aa  157  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.581519  hitchhiker  0.0000000487661 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0657  ATP-dependent RNA helicase  30.12 
 
 
450 aa  156  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.32 
 
 
484 aa  156  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1434  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.83 
 
 
427 aa  156  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.605278 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10125  ATP-dependent RNA helicase (Drs1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14990)  28.85 
 
 
814 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00305342  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3215  putative ATP-dependent RNA helicase SrmB  28.4 
 
 
448 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.571925  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1015  DEAD/DEAH box helicase-like  27.64 
 
 
393 aa  156  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2445  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.78 
 
 
451 aa  156  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.959093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.39 
 
 
501 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4277  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.15 
 
 
485 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.9 
 
 
494 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.41 
 
 
465 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4337  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.15 
 
 
485 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  29.22 
 
 
451 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  30.7 
 
 
411 aa  154  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  30.3 
 
 
491 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.54 
 
 
425 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.88 
 
 
460 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000327397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.3 
 
 
489 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_1703  nucleolar DEAD-box protein required for synthesis of 60S ribosomal subunits  26.2 
 
 
672 aa  153  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2006  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.94 
 
 
483 aa  153  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  29.4 
 
 
480 aa  153  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.98 
 
 
521 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.86 
 
 
441 aa  153  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1417  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.06 
 
 
468 aa  153  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0306268  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.73 
 
 
505 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  30.7 
 
 
420 aa  153  8e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.73 
 
 
452 aa  153  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0042  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.61 
 
 
420 aa  153  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.47 
 
 
525 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>