More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27993 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009370  OSTLU_27993  predicted protein  100 
 
 		 264 aa  529  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0936096  normal  0.139747 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0604  pseudouridine synthase, RluD  37.11 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.206987 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  30.33 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  35.25 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0447  pseudouridylate synthase  38.98 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129188  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  34.77 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3519  pseudouridine synthase  31.58 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.108825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0311  pseudouridine synthase  32.5 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.148955 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  31.73 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  34.38 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2132  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.94 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864009 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.61 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0059  RluA family pseudouridine synthase  34.26 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1813  pseudouridine synthase, RluA family  37.29 
 
 		 526 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000964916  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1344  pseudouridine synthase, RluA family  30.89 
 
 		 313 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4177  pseudouridine synthase, RluD  33.33 
 
 		 318 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.463318  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1633  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.23 
 
 		 350 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.784854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4330  pseudouridine synthase, RluA family  33.33 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  27.16 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4308  pseudouridine synthase, RluA family  32.32 
 
 		 323 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1849  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.4 
 
 		 316 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.97184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1413  pseudouridine synthase, RluA family  29.88 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0119542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.11 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5026  RluA family pseudouridine synthase  34.21 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.257508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1658  RluA family pseudouridine synthase  33.2 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.615207  normal  0.0770781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1420  pseudouridine synthase, RluA family  34.4 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  32.92 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1856  RluA family pseudouridine synthase  36.18 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  35.41 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3490  pseudouridine synthase, RluA family  31.08 
 
 		 329 aa  106  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.788611  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3526  pseudouridine synthase, RluA family  41.71 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.276057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4412  pseudouridine synthase  34.44 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0574  RluA family pseudouridine synthase  31.22 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000115636  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0878  pseudouridine synthase RluA family  32.8 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.936233  normal  0.697349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5337  pseudouridine synthase  36.6 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.588803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2588  pseudouridine synthase, RluA family  30.98 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2574  pseudouridine synthase, RluA family  33.06 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0131416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  31.08 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1918  pseudouridylate synthase  36.03 
 
 		 331 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.313476  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3435  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.87 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  33.47 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  32.28 
 
 		 306 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  31.5 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0431  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.79 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0593  pseudouridine synthase, RluA family  32.79 
 
 		 310 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.070842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0998  pseudouridine synthase, RluA family  35.34 
 
 		 547 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.012801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1632  pseudouridine synthase, RluA family  31.84 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0569  putative RNA pseudouridylate synthase  35.78 
 
 		 561 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  30.89 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1751  pseudouridine synthase  32.87 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0485075  normal  0.0112767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1430  pseudouridine synthase  33.48 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0984  pseudouridine synthase, RluA family  29.96 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0148654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  34.66 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2844  pseudouridine synthase  33.47 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2722  pseudouridine synthase  34.44 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0069  pseudouridine synthase  34.16 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04873  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.2 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  32.8 
 
 		 331 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3462  pseudouridine synthase, RluA family  40 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2949  pseudouridine synthase  34.02 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316024  hitchhiker  0.00664146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1376  pseudouridine synthase  46.58 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2615  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.54 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0357699  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  27.05 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.85 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2710  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.08 
 
 		 368 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1390  pseudouridine synthase  34.54 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10250  predicted protein  33.21 
 
 		 243 aa  102  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0592029  normal  0.114227 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2620  RluA family pseudouridine synthase  31.7 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2896  pseudouridine synthase  32.09 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.76004  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.47 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2356  RluA family pseudouridine synthase  27.82 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0073  pseudouridine synthase, RluA family  31.4 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0061  pseudouridine synthase, RluA family  31.78 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1100  pseudouridine synthase, RluA family  27.23 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1288  RluA family pseudouridine synthase  31.38 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.543506  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1093  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.91 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.34 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0913  pseudouridine synthase  34.95 
 
 		 566 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000952399  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl387  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase  28.17 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.319286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3379  pseudouridine synthase, RluD  39.53 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.75 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1043  pseudouridine synthase  44.85 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0777  pseudouridine synthase, RluA family  30.58 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0345  pseudouridine synthase  31.94 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2488  pseudouridylate synthase  32.31 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  31.02 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.72 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1370  pseudouridine synthase, RluD  32.68 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0056  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.4 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4321  RluA family pseudouridine synthase  32.58 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1798  pseudouridine synthase, RluA family  29.07 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  31.95 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0540  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.29 
 
 		 323 aa  99.8  4e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.373783  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1622  pseudouridine synthase, RluD  27.34 
 
 		 363 aa  99.8  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0047  pseudouridine synthase, RluD  33.47 
 
 		 295 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1442  pseudouridylate synthase  33.04 
 
 		 223 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81175  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  30.08 
 
 		 315 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  31.1 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  30.25 
 
 		 304 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2102  pseudouridine synthase, RluD  32.3 
 
 		 405 aa  99.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>