More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_10250 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_10250  predicted protein  100 
 
 
243 aa  501  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0592029  normal  0.114227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  40.74 
 
 
315 aa  141  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  35.34 
 
 
306 aa  141  8e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0604  pseudouridine synthase, RluD  38 
 
 
341 aa  138  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.206987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4836  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.08 
 
 
320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  34.41 
 
 
314 aa  135  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0318  RluA  34.76 
 
 
299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264747  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  38.84 
 
 
541 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0726  pseudouridine synthase, RluD  36.67 
 
 
320 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2859  pseudouridine synthase, RluD  38.52 
 
 
264 aa  134  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0827  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.67 
 
 
320 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.587851  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2588  pseudouridine synthase, RluA family  36.55 
 
 
325 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4547  RluA family pseudouridine synthase  35.42 
 
 
352 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11940  Pseudouridine synthase  36.25 
 
 
336 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0663  RluA family pseudouridine synthase  35.83 
 
 
352 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3611  RluA family pseudouridine synthase  36.4 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354938  hitchhiker  0.00827113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0632  pseudouridine synthase, RluD  34.78 
 
 
334 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.67 
 
 
313 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1112  RluA family pseudouridine synthase  34.78 
 
 
334 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.79 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.65 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  34.8 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  35.2 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0669  RluA family pseudouridine synthase  35.56 
 
 
352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2118  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.6 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1070  RluA family pseudouridine synthase  34.78 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0527141  normal  0.0360601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2132  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.2 
 
 
332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.864009 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.39 
 
 
300 aa  129  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15960  predicted protein  33.07 
 
 
325 aa  129  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1440  pseudouridine synthase, RluA family  33.46 
 
 
347 aa  129  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.738263  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  32.79 
 
 
319 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  32.39 
 
 
302 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1849  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.25 
 
 
316 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.97184  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2215  RluA family pseudouridine synthase  34.46 
 
 
341 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0992  RluA family pseudouridine synthase  34.78 
 
 
316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.51 
 
 
356 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0988  RluA family pseudouridine synthase  34.78 
 
 
334 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  37.04 
 
 
320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  35.29 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0372  pseudouridine synthase, RluA family  36.4 
 
 
334 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  35.27 
 
 
436 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5183  pseudouridine synthase  34.58 
 
 
320 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.521194  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1612  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.55 
 
 
356 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000933226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6759  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.16 
 
 
326 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0680  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  35.1 
 
 
299 aa  128  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1958  RluA family pseudouridine synthase  37.1 
 
 
293 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.576308  normal  0.790812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1742  pseudouridine synthase, RluD  35.42 
 
 
376 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0441246 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  36.64 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0947  pseudouridine synthase, RluA family  36.64 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.48756 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  35.29 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  37.34 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  32.66 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4321  RluA family pseudouridine synthase  35.46 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1817  RluA family pseudouridine synthase  34.69 
 
 
360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1919  pseudouridine synthase, RluA family  36.13 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338974  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  37.6 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0665  hypothetical protein  31.5 
 
 
341 aa  126  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1813  RluA family pseudouridine synthase  35.83 
 
 
389 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1324  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.83 
 
 
395 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2333  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.83 
 
 
395 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4224  pseudouridine synthase, RluD  35.44 
 
 
334 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.12 
 
 
402 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  35.08 
 
 
331 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0083  RluA family pseudouridine synthase  35.83 
 
 
389 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1084  RluA family pseudouridine synthase  35.83 
 
 
389 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.346306  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.87 
 
 
403 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270637  normal  0.743014 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  35.12 
 
 
402 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  35.12 
 
 
402 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  34.03 
 
 
400 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1591  pseudouridine synthase, RluA family  36.13 
 
 
370 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  decreased coverage  0.00904495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0969  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35 
 
 
324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0521  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.02 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2490  RluA family pseudouridine synthase  35.02 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000151813  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2205  RluA family pseudouridine synthase  35.83 
 
 
395 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.44 
 
 
391 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2168  RluA family pseudouridine synthase  35.83 
 
 
389 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2862  RluA family pseudouridine synthase  35.02 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0569131  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.45 
 
 
438 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1572  RluA family pseudouridine synthase  34.16 
 
 
420 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00305296  hitchhiker  0.00710721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60210  pseudouridine synthase  33.75 
 
 
320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135219 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1813  RluA family pseudouridine synthase  35.02 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0797823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2792  RluA family pseudouridine synthase  35.02 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449267  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  34.69 
 
 
407 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2917  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.02 
 
 
477 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00370322  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  34.69 
 
 
405 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2801  RluA family pseudouridine synthase  35.02 
 
 
335 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000617612  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  37.04 
 
 
309 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1284  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  35.56 
 
 
292 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2613  RluA family pseudouridine synthase  36.11 
 
 
343 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0916  RluA family pseudouridine synthase  35 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  33.33 
 
 
306 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  35.12 
 
 
431 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1813  pseudouridine synthase, RluA family  36.18 
 
 
526 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000964916  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2141  pseudouridine synthase, RluD  38.08 
 
 
339 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1390  pseudouridine synthase, RluA family  33.07 
 
 
348 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1324  pseudouridine synthase, RluA family  34.27 
 
 
328 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.33 
 
 
325 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0714  23S rRNA pseudouridylate synthase C  34.32 
 
 
326 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28001  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  37.99 
 
 
324 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1072  RluA family pseudouridine synthase  33.09 
 
 
349 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0863187  normal  0.714428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>