285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4398 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  74.24 
 
 		 515 aa  711    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  70.08 
 
 		 514 aa  638    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  67.55 
 
 		 517 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  71.89 
 
 		 534 aa  703    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  72.14 
 
 		 514 aa  721    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  63.65 
 
 		 517 aa  637    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  71.76 
 
 		 526 aa  677    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 533 aa  1037    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  73.9 
 
 		 514 aa  709    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  67.46 
 
 		 544 aa  632  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  73.64 
 
 		 503 aa  621  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  62.08 
 
 		 530 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  62.38 
 
 		 530 aa  610  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  63.22 
 
 		 537 aa  598  1e-170  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  69.65 
 
 		 514 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  61.79 
 
 		 518 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  55.02 
 
 		 512 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  57 
 
 		 509 aa  497  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  55.02 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  52.94 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  43.44 
 
 		 507 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  48.55 
 
 		 506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  47.34 
 
 		 520 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  49.22 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  45.65 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  44.74 
 
 		 509 aa  392  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  43.34 
 
 		 508 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  41.2 
 
 		 516 aa  375  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  47.38 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  47.23 
 
 		 517 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  43.03 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  40.76 
 
 		 489 aa  364  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  42.15 
 
 		 507 aa  362  1e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  44.64 
 
 		 526 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  44.47 
 
 		 511 aa  361  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  49.69 
 
 		 508 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  43.53 
 
 		 524 aa  360  5e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  43.47 
 
 		 505 aa  359  6e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  49.28 
 
 		 508 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  43.03 
 
 		 512 aa  359  6e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  48.61 
 
 		 499 aa  359  8e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  49.49 
 
 		 508 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  42.54 
 
 		 498 aa  354  2.9999999999999997e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  40.51 
 
 		 497 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  44.31 
 
 		 513 aa  353  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  41.45 
 
 		 522 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  44.47 
 
 		 518 aa  350  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  43.5 
 
 		 507 aa  349  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  42.01 
 
 		 510 aa  349  9e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  38.18 
 
 		 523 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  43.14 
 
 		 507 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  42.06 
 
 		 510 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  43.5 
 
 		 507 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  41.83 
 
 		 533 aa  346  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  44.94 
 
 		 516 aa  346  8e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  41.87 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  42.5 
 
 		 518 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  47.86 
 
 		 508 aa  343  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  42.18 
 
 		 511 aa  343  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  41.47 
 
 		 510 aa  343  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 		 513 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  41.93 
 
 		 511 aa  342  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 		 513 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 		 513 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 		 513 aa  342  8e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  42.01 
 
 		 511 aa  342  9e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  42.18 
 
 		 497 aa  342  1e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  42.97 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  42.97 
 
 		 507 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  42.13 
 
 		 518 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 		 513 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  42.6 
 
 		 514 aa  341  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  41.9 
 
 		 519 aa  341  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  42.31 
 
 		 518 aa  339  8e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  41.73 
 
 		 511 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  41.26 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  42.07 
 
 		 514 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  42.47 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  43.87 
 
 		 507 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  44.22 
 
 		 514 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  42.62 
 
 		 515 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 		 538 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  42.35 
 
 		 514 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 		 533 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 		 529 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 		 507 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  42.16 
 
 		 511 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 		 507 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  41.54 
 
 		 511 aa  336  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 		 507 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  43.31 
 
 		 507 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 		 529 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 		 507 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  43.82 
 
 		 515 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  41.22 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  43.58 
 
 		 507 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  43.09 
 
 		 517 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4104  histidine ammonia-lyase  42.7 
 
 		 563 aa  335  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  40.67 
 
 		 513 aa  334  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  40.67 
 
 		 513 aa  334  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>