285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3619 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  71.68 
 
 
526 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  77.37 
 
 
503 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  68.3 
 
 
544 aa  642    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  67.27 
 
 
537 aa  637    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  79.13 
 
 
515 aa  760    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  78.94 
 
 
514 aa  775    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  69.73 
 
 
517 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
514 aa  1005    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  66.03 
 
 
530 aa  652    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  77.21 
 
 
534 aa  741    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  73.71 
 
 
533 aa  701    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  65.07 
 
 
530 aa  633  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  70.1 
 
 
514 aa  632  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  60.85 
 
 
517 aa  605  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  66.4 
 
 
518 aa  595  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  71.2 
 
 
514 aa  579  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  59.92 
 
 
512 aa  541  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  60.12 
 
 
512 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  60.72 
 
 
509 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  52.99 
 
 
506 aa  437  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  48.13 
 
 
511 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  44.6 
 
 
507 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  50.79 
 
 
513 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  46.86 
 
 
509 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  50.81 
 
 
506 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  43.64 
 
 
516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  44.47 
 
 
508 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  47.94 
 
 
520 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  46.9 
 
 
516 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  43.85 
 
 
505 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  43.8 
 
 
507 aa  386  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  51.11 
 
 
499 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  46.85 
 
 
511 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
489 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  48.61 
 
 
517 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  47.24 
 
 
526 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  44.62 
 
 
524 aa  375  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
523 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  42.51 
 
 
497 aa  367  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  45.95 
 
 
518 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  44.42 
 
 
507 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  42.15 
 
 
522 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  43.53 
 
 
508 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
536 aa  365  2e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  51.98 
 
 
508 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  51.1 
 
 
508 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  44.09 
 
 
533 aa  362  6e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  44.53 
 
 
507 aa  362  9e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  51.76 
 
 
508 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  44.18 
 
 
507 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  43.37 
 
 
512 aa  360  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  44.32 
 
 
498 aa  359  6e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  44.74 
 
 
507 aa  359  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  42.35 
 
 
538 aa  358  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  40.37 
 
 
497 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  44.42 
 
 
507 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4104  histidine ammonia-lyase  43.07 
 
 
563 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  44.65 
 
 
507 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  43.86 
 
 
510 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  45.3 
 
 
511 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  45.98 
 
 
504 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  45.85 
 
 
508 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  44.65 
 
 
507 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
533 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
529 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
507 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
507 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
529 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
507 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  43.92 
 
 
518 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  43.46 
 
 
513 aa  352  7e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  45.85 
 
 
513 aa  351  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  44.42 
 
 
507 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  43.92 
 
 
518 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  43.26 
 
 
510 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00727  histidine ammonia-lyase  50.33 
 
 
513 aa  350  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.396834  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  44.69 
 
 
511 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  44.99 
 
 
511 aa  348  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  43.43 
 
 
511 aa  348  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  44.99 
 
 
511 aa  348  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  43.84 
 
 
514 aa  347  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  41.72 
 
 
528 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1653  histidine ammonia-lyase  48.45 
 
 
513 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129126  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  47.26 
 
 
515 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  44.61 
 
 
518 aa  344  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  42.74 
 
 
514 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  44.66 
 
 
515 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  46.26 
 
 
510 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  42.57 
 
 
510 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  44.69 
 
 
514 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  42.48 
 
 
510 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  40.65 
 
 
503 aa  344  2.9999999999999997e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  44.22 
 
 
506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  43.47 
 
 
510 aa  343  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  42.77 
 
 
519 aa  342  8e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1579  histidine ammonia-lyase  45.23 
 
 
507 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179802  normal  0.0722817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 
513 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 
506 aa  342  9e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  42.66 
 
 
513 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  42.32 
 
 
511 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>