285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0576 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 509 aa  991    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  58.84 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  60.77 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  56.75 
 
 		 530 aa  529  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  58.25 
 
 		 537 aa  527  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  58.63 
 
 		 515 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  56.63 
 
 		 530 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  59.43 
 
 		 534 aa  524  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  62.78 
 
 		 512 aa  520  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  63.13 
 
 		 512 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  60.72 
 
 		 514 aa  511  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  58.79 
 
 		 514 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  61.15 
 
 		 526 aa  500  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  56.81 
 
 		 533 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  56.06 
 
 		 518 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  52.17 
 
 		 517 aa  479  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  54.9 
 
 		 544 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  61.19 
 
 		 503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  51.58 
 
 		 513 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  46.45 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  48.99 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  56.12 
 
 		 514 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  52.35 
 
 		 506 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  44.18 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  51.53 
 
 		 506 aa  425  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  44.91 
 
 		 508 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  46.65 
 
 		 498 aa  424  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  49.49 
 
 		 520 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  46.73 
 
 		 511 aa  413  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  44.73 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  48.65 
 
 		 526 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  48.2 
 
 		 516 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  43.4 
 
 		 489 aa  405  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  51.52 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  45.17 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  51.06 
 
 		 508 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  51.8 
 
 		 508 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  52.01 
 
 		 508 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  46.72 
 
 		 513 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  44.64 
 
 		 505 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  47 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  45.87 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  45.34 
 
 		 508 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  41.19 
 
 		 528 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  46.9 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  44 
 
 		 522 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  45.72 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  43.71 
 
 		 511 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  47.98 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  47.98 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  46.88 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  46.65 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  44.19 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  45.68 
 
 		 511 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  43.39 
 
 		 519 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  44.94 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  44.07 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 		 536 aa  372  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 		 505 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  47.98 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  45.49 
 
 		 538 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  47.76 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 		 505 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  46.41 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  46.78 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  42.24 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  44.26 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  49.55 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  47.98 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 		 505 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  43.12 
 
 		 511 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  43.98 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  43.78 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  46.02 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  46.81 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 		 505 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  43.84 
 
 		 514 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  43.98 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  43.98 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  43.27 
 
 		 512 aa  368  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  43.98 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  41.26 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  43.78 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  45.56 
 
 		 512 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  41.7 
 
 		 523 aa  364  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  42.92 
 
 		 511 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  48.13 
 
 		 515 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  45.42 
 
 		 506 aa  363  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  45.63 
 
 		 515 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  43.4 
 
 		 524 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  48.45 
 
 		 518 aa  362  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>