286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3001 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  71.09 
 
 		 526 aa  646    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  77.43 
 
 		 514 aa  741    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  77.21 
 
 		 514 aa  726    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 534 aa  1048    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  72.71 
 
 		 517 aa  652    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  70.78 
 
 		 514 aa  653    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  77.58 
 
 		 515 aa  733    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  71.89 
 
 		 533 aa  685    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  67.13 
 
 		 537 aa  630  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  75.26 
 
 		 503 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  65.06 
 
 		 530 aa  626  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  65.38 
 
 		 530 aa  624  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  66.48 
 
 		 544 aa  615  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  67.19 
 
 		 518 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  61.69 
 
 		 517 aa  587  1e-166  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  69.84 
 
 		 514 aa  571  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  58.7 
 
 		 512 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  58.5 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  59.43 
 
 		 509 aa  514  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  53.45 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  52.32 
 
 		 506 aa  421  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  44.29 
 
 		 507 aa  415  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  47.29 
 
 		 511 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  51 
 
 		 506 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  44.18 
 
 		 507 aa  396  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  42.8 
 
 		 516 aa  395  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  46.26 
 
 		 509 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  43.96 
 
 		 508 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  46.95 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  42.8 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  42.11 
 
 		 489 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  44.07 
 
 		 512 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  45.44 
 
 		 526 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  45.21 
 
 		 536 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  45.88 
 
 		 511 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  43.91 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  43.93 
 
 		 510 aa  363  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  42.14 
 
 		 522 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  44.13 
 
 		 511 aa  363  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  43.17 
 
 		 513 aa  363  6e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  44.51 
 
 		 510 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  43.17 
 
 		 513 aa  362  9e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  43.17 
 
 		 513 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  43.17 
 
 		 513 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  48.19 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  43.14 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  42.42 
 
 		 510 aa  361  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  42.97 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  42.97 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  44.62 
 
 		 498 aa  358  9.999999999999999e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  42.97 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  42.77 
 
 		 513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  43.29 
 
 		 510 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  43.52 
 
 		 506 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  44.25 
 
 		 507 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  50.66 
 
 		 508 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  43.87 
 
 		 524 aa  356  6.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  43.94 
 
 		 511 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  43.83 
 
 		 507 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  45.05 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  50.66 
 
 		 508 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  45.53 
 
 		 516 aa  353  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  43.07 
 
 		 511 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  43.37 
 
 		 510 aa  353  5e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  50 
 
 		 508 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 		 523 aa  352  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  43.37 
 
 		 513 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  43 
 
 		 512 aa  350  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  40.64 
 
 		 497 aa  349  6e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 		 513 aa  349  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  43.67 
 
 		 511 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  42.51 
 
 		 514 aa  349  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  43.19 
 
 		 511 aa  349  8e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  43.79 
 
 		 507 aa  349  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 		 506 aa  349  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 		 511 aa  349  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  43.19 
 
 		 511 aa  349  9e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  43.06 
 
 		 511 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 		 514 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  43.79 
 
 		 507 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  41.75 
 
 		 538 aa  348  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  43.99 
 
 		 507 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  46.51 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  42.2 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  43.79 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  42.57 
 
 		 514 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  39.2 
 
 		 528 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  43.84 
 
 		 507 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  43.26 
 
 		 511 aa  346  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  44.72 
 
 		 507 aa  346  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  44.06 
 
 		 507 aa  346  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  46.27 
 
 		 518 aa  346  8e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  44.51 
 
 		 507 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  44.51 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  44.51 
 
 		 507 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  44.54 
 
 		 515 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>