285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04180 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 544 aa  1071    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  66.54 
 
 		 514 aa  654    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  68.3 
 
 		 514 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  66.73 
 
 		 515 aa  641    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  66.48 
 
 		 534 aa  632  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  63.04 
 
 		 530 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  67.28 
 
 		 533 aa  625  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  65.15 
 
 		 526 aa  615  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  65.11 
 
 		 537 aa  617  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  61.6 
 
 		 530 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  66.41 
 
 		 514 aa  614  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  60.63 
 
 		 517 aa  598  1e-169  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  63.18 
 
 		 517 aa  584  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  67.33 
 
 		 503 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  62.36 
 
 		 518 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  63 
 
 		 514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  54.9 
 
 		 509 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  53.3 
 
 		 512 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  53.3 
 
 		 512 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  48.5 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  41.41 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  43.21 
 
 		 511 aa  365  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  40.34 
 
 		 516 aa  363  5.0000000000000005e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  42.41 
 
 		 510 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  42.8 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  46.11 
 
 		 536 aa  359  6e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  42.61 
 
 		 513 aa  359  8e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  42.41 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  42.41 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  42.41 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  41.83 
 
 		 510 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  40.15 
 
 		 507 aa  358  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  42.22 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  42.41 
 
 		 512 aa  354  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  41.86 
 
 		 510 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  41.6 
 
 		 509 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  41.44 
 
 		 513 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  41.44 
 
 		 513 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  41.44 
 
 		 513 aa  351  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  44.05 
 
 		 526 aa  351  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  40.27 
 
 		 508 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  41.25 
 
 		 510 aa  350  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  40.4 
 
 		 523 aa  349  6e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  43.42 
 
 		 505 aa  348  2e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  41.05 
 
 		 510 aa  345  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  48.05 
 
 		 508 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  48.05 
 
 		 508 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  47.53 
 
 		 508 aa  343  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  44.47 
 
 		 506 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  43.21 
 
 		 520 aa  340  5e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  42.29 
 
 		 498 aa  335  2e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  43.43 
 
 		 516 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  41.25 
 
 		 508 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  40.95 
 
 		 489 aa  333  7.000000000000001e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  41.7 
 
 		 511 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  39.69 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  43.72 
 
 		 517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  41.78 
 
 		 507 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  38.82 
 
 		 497 aa  327  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  42.5 
 
 		 506 aa  327  4.0000000000000003e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  41.43 
 
 		 513 aa  327  5e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  40.69 
 
 		 507 aa  327  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  44.17 
 
 		 508 aa  326  5e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  40.54 
 
 		 513 aa  326  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  39.85 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  42.09 
 
 		 511 aa  323  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  41.56 
 
 		 511 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4104  histidine ammonia-lyase  40.55 
 
 		 563 aa  323  6e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  40.04 
 
 		 533 aa  323  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  41.38 
 
 		 518 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  40.33 
 
 		 524 aa  322  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  39.76 
 
 		 511 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  39.16 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  40.19 
 
 		 519 aa  322  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  46.06 
 
 		 508 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  41.76 
 
 		 518 aa  321  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  41.06 
 
 		 507 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  40.81 
 
 		 507 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  41.76 
 
 		 518 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  39.31 
 
 		 506 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  39.31 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  41.56 
 
 		 511 aa  319  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  39.07 
 
 		 503 aa  318  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  39.31 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  39.31 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  39.31 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  39.46 
 
 		 511 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  38.26 
 
 		 538 aa  317  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  41.49 
 
 		 529 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  41.45 
 
 		 511 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  40.78 
 
 		 507 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  41.49 
 
 		 533 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  41.49 
 
 		 529 aa  317  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  40.64 
 
 		 511 aa  316  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  41.06 
 
 		 511 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 		 535 aa  316  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  41.73 
 
 		 507 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  40.46 
 
 		 518 aa  316  7e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  43.55 
 
 		 499 aa  316  7e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  41.54 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>