285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0231 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 533 aa  1072    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  57.79 
 
 		 535 aa  579  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  43.53 
 
 		 508 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  42.05 
 
 		 530 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  39.5 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  41.33 
 
 		 530 aa  379  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  39.32 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  44.88 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  41.9 
 
 		 537 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  41.81 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  42.69 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 		 505 aa  364  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 		 505 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 		 505 aa  363  6e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 		 505 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 		 505 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  41.88 
 
 		 507 aa  362  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 		 505 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 		 505 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 		 505 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 		 505 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 		 506 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  39.8 
 
 		 505 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  43.46 
 
 		 509 aa  352  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  42.29 
 
 		 509 aa  352  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  43.7 
 
 		 514 aa  351  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  41.28 
 
 		 504 aa  349  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  41.28 
 
 		 504 aa  349  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  43.28 
 
 		 515 aa  349  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  44.29 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  38.73 
 
 		 505 aa  348  2e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  39.76 
 
 		 498 aa  342  7e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  42.04 
 
 		 534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  39.74 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  42.45 
 
 		 518 aa  339  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  42.14 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  37.35 
 
 		 509 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  36.83 
 
 		 507 aa  337  2.9999999999999997e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  41.28 
 
 		 516 aa  336  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  43.55 
 
 		 512 aa  336  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  44.03 
 
 		 512 aa  335  9e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  41.6 
 
 		 520 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  41.04 
 
 		 526 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  42.8 
 
 		 517 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  39.81 
 
 		 513 aa  330  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  37.85 
 
 		 522 aa  329  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  45.05 
 
 		 508 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  42.19 
 
 		 533 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  41.89 
 
 		 506 aa  326  6e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  44.63 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  39.26 
 
 		 517 aa  325  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  42.4 
 
 		 526 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  45.05 
 
 		 508 aa  323  6e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  38.56 
 
 		 502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  39.48 
 
 		 530 aa  321  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  40.73 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  39.01 
 
 		 536 aa  318  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  40.04 
 
 		 544 aa  316  6e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  40.59 
 
 		 523 aa  316  7e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  36.99 
 
 		 524 aa  315  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  39.4 
 
 		 528 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  40.7 
 
 		 523 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  38.62 
 
 		 540 aa  312  7.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  40.66 
 
 		 514 aa  311  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4104  histidine ammonia-lyase  39.25 
 
 		 563 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  39.41 
 
 		 715 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  42.41 
 
 		 503 aa  310  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  37.68 
 
 		 514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  35.14 
 
 		 528 aa  307  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  35.85 
 
 		 497 aa  307  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  39.8 
 
 		 517 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  34.91 
 
 		 512 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  37.31 
 
 		 538 aa  302  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  34.01 
 
 		 506 aa  301  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  41.15 
 
 		 499 aa  300  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  36.58 
 
 		 523 aa  298  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  39.34 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 		 507 aa  297  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  39.3 
 
 		 515 aa  297  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  36.9 
 
 		 513 aa  296  6e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  40.67 
 
 		 515 aa  293  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  35.33 
 
 		 511 aa  292  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  37.7 
 
 		 510 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  40.79 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  38.17 
 
 		 510 aa  291  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  38.33 
 
 		 511 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  37.45 
 
 		 518 aa  290  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  37.99 
 
 		 507 aa  290  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  37.82 
 
 		 512 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  37.52 
 
 		 510 aa  287  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  37.13 
 
 		 510 aa  286  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  37.74 
 
 		 511 aa  286  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  40.23 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  36.44 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  39.36 
 
 		 506 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  38.33 
 
 		 511 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  37.53 
 
 		 513 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  39.36 
 
 		 506 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  39.15 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>