284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3005 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2935  histidine ammonia-lyase  72.8 
 
 		 507 aa  666    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 507 aa  1015    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1579  histidine ammonia-lyase  73.6 
 
 		 507 aa  675    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179802  normal  0.0722817 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  71.34 
 
 		 513 aa  696    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  65.25 
 
 		 511 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  64.79 
 
 		 511 aa  620  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  64.19 
 
 		 511 aa  613  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  64.72 
 
 		 512 aa  608  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  62.42 
 
 		 511 aa  606  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  63.56 
 
 		 511 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  63.1 
 
 		 515 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  63.36 
 
 		 511 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  62.73 
 
 		 511 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  58.7 
 
 		 513 aa  567  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  59.37 
 
 		 515 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  57.26 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  59.8 
 
 		 508 aa  554  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1653  histidine ammonia-lyase  57.91 
 
 		 513 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129126  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  57.6 
 
 		 507 aa  534  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  56.37 
 
 		 509 aa  528  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00727  histidine ammonia-lyase  57.23 
 
 		 513 aa  521  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.396834  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1689  histidine ammonia-lyase  56.6 
 
 		 509 aa  522  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  56.05 
 
 		 518 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  54.75 
 
 		 518 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  53.27 
 
 		 518 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  52.44 
 
 		 507 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  52.28 
 
 		 514 aa  498  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  50.49 
 
 		 538 aa  498  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  52.11 
 
 		 506 aa  495  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  51.93 
 
 		 519 aa  497  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  52.32 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  51.53 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  53.25 
 
 		 515 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  52.12 
 
 		 506 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  50.91 
 
 		 511 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  52.12 
 
 		 506 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  51.72 
 
 		 514 aa  488  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  52.22 
 
 		 511 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  52.12 
 
 		 506 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  51.83 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  51.72 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  52.02 
 
 		 510 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  52.3 
 
 		 507 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  51.42 
 
 		 515 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  52.74 
 
 		 529 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  52.94 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  50.81 
 
 		 510 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  52.94 
 
 		 507 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  54.98 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  52.1 
 
 		 507 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  52.64 
 
 		 507 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  51.32 
 
 		 511 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  52.5 
 
 		 507 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  52.94 
 
 		 507 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  54.16 
 
 		 518 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  52.74 
 
 		 533 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  51.3 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  52.74 
 
 		 507 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  54.96 
 
 		 517 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  52.74 
 
 		 507 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  51.9 
 
 		 507 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  49.59 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  51.3 
 
 		 510 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0796  histidine ammonia-lyase  52.5 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  52.13 
 
 		 514 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  51.32 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  51.71 
 
 		 520 aa  475  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  51.22 
 
 		 510 aa  475  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  51.61 
 
 		 507 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  49.08 
 
 		 509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  50.9 
 
 		 510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  49.8 
 
 		 514 aa  468  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2716  histidine ammonia-lyase  55.56 
 
 		 526 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  50.7 
 
 		 510 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2855  histidine ammonia-lyase  55.56 
 
 		 522 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  51.02 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5905  histidine ammonia-lyase  52.44 
 
 		 507 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  50.82 
 
 		 512 aa  465  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2172  histidine ammonia-lyase  52.44 
 
 		 507 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  50.2 
 
 		 510 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  51.02 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  51.02 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  50.61 
 
 		 510 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  51.02 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  51.02 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  51.42 
 
 		 506 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  51.02 
 
 		 513 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  51.02 
 
 		 513 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  50.82 
 
 		 513 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  51.02 
 
 		 513 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  50.61 
 
 		 510 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67320  histidine ammonia-lyase  52.32 
 
 		 509 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5831  histidine ammonia-lyase  52.32 
 
 		 524 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  51.14 
 
 		 511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4137  histidine ammonia-lyase  50.81 
 
 		 510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0926785  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4085  histidine ammonia-lyase  51.02 
 
 		 510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0077  histidine ammonia-lyase  51.02 
 
 		 510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0149  histidine ammonia-lyase  53.7 
 
 		 523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26290  histidine ammonia-lyase  52.04 
 
 		 509 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  49.49 
 
 		 510 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>