285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1047 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  65.31 
 
 		 511 aa  684    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 502 aa  1043    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  68.19 
 
 		 506 aa  714    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  57.79 
 
 		 512 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  55.65 
 
 		 513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  54.67 
 
 		 509 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  36.95 
 
 		 508 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  36.35 
 
 		 505 aa  326  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  35.94 
 
 		 505 aa  326  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  35.94 
 
 		 505 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  35.74 
 
 		 505 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  35.74 
 
 		 505 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  35.74 
 
 		 505 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  35.74 
 
 		 505 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  35.74 
 
 		 505 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  35.54 
 
 		 506 aa  323  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  35.54 
 
 		 505 aa  322  8e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  38.56 
 
 		 533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  35.54 
 
 		 505 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  36.67 
 
 		 504 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  36.68 
 
 		 516 aa  312  9e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  38.41 
 
 		 498 aa  311  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  38.4 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  34.92 
 
 		 504 aa  304  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  34.92 
 
 		 504 aa  304  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  35.14 
 
 		 511 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  38.22 
 
 		 508 aa  302  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  38.85 
 
 		 523 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  38.27 
 
 		 523 aa  299  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  35.82 
 
 		 507 aa  298  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  36.08 
 
 		 506 aa  293  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  34.69 
 
 		 507 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  34.43 
 
 		 509 aa  289  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  34.14 
 
 		 519 aa  289  9e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  38.55 
 
 		 517 aa  289  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  34.06 
 
 		 520 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  35.14 
 
 		 540 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  35.24 
 
 		 505 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  37.44 
 
 		 489 aa  283  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  34.68 
 
 		 518 aa  282  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  33.89 
 
 		 508 aa  280  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  36.65 
 
 		 526 aa  279  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  35.96 
 
 		 506 aa  279  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  35.47 
 
 		 521 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  35.62 
 
 		 509 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  33.67 
 
 		 520 aa  277  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  34.72 
 
 		 515 aa  276  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  35.03 
 
 		 520 aa  276  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  37.86 
 
 		 511 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  33.59 
 
 		 516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  35.01 
 
 		 518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  37.12 
 
 		 499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  35.06 
 
 		 520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  34.5 
 
 		 520 aa  273  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  36.24 
 
 		 521 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  31.25 
 
 		 515 aa  272  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  32.56 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  34.83 
 
 		 524 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  34.66 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  34.71 
 
 		 521 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  36.29 
 
 		 530 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  36.19 
 
 		 524 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  32.56 
 
 		 506 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  32.56 
 
 		 506 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  32.56 
 
 		 506 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  33.06 
 
 		 510 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  32.56 
 
 		 506 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  35.21 
 
 		 524 aa  270  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  32.93 
 
 		 532 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  36.19 
 
 		 524 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  36.19 
 
 		 524 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  32.93 
 
 		 532 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  35.74 
 
 		 715 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  34.5 
 
 		 521 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  34.62 
 
 		 524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  33.53 
 
 		 536 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  31.8 
 
 		 507 aa  266  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  33.94 
 
 		 531 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  32.21 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  32.82 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  33.26 
 
 		 513 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  33.77 
 
 		 511 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  31.8 
 
 		 515 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  34.71 
 
 		 508 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  34.57 
 
 		 510 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  34.08 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  34.68 
 
 		 528 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  33.05 
 
 		 513 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  31.51 
 
 		 513 aa  264  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  35.38 
 
 		 514 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  33.05 
 
 		 513 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  33.13 
 
 		 540 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  33.05 
 
 		 513 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  33.05 
 
 		 513 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  33.95 
 
 		 508 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 540 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  33.12 
 
 		 510 aa  262  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  32.73 
 
 		 511 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  35.64 
 
 		 530 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4004  histidine ammonia-lyase  31.47 
 
 		 537 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187247  normal  0.249864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>