285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4767 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  78.26 
 
 		 528 aa  826    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 532 aa  1074    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 532 aa  1074    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  76.76 
 
 		 531 aa  792    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  76.41 
 
 		 540 aa  776    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  76.41 
 
 		 540 aa  780    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  76.04 
 
 		 531 aa  790    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  76.76 
 
 		 531 aa  791    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  61.55 
 
 		 518 aa  601  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  59.28 
 
 		 517 aa  589  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  58.17 
 
 		 511 aa  585  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  61.3 
 
 		 514 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  57.64 
 
 		 520 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  58.85 
 
 		 520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  58.57 
 
 		 520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  60.49 
 
 		 515 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  57.67 
 
 		 524 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  57.67 
 
 		 524 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  57.67 
 
 		 524 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  58.65 
 
 		 519 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  57.65 
 
 		 524 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  57.67 
 
 		 524 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  59.33 
 
 		 516 aa  571  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  57.17 
 
 		 520 aa  566  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  57.14 
 
 		 521 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  57.23 
 
 		 521 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  57.26 
 
 		 521 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  57.46 
 
 		 521 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  58.13 
 
 		 528 aa  545  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  56.55 
 
 		 511 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  44.07 
 
 		 540 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  43.7 
 
 		 715 aa  350  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  37.5 
 
 		 506 aa  345  8e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  39.07 
 
 		 511 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  36.46 
 
 		 516 aa  292  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  36.95 
 
 		 508 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  36.42 
 
 		 509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  34.06 
 
 		 507 aa  283  8.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  35.84 
 
 		 508 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  34.31 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  35.66 
 
 		 520 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  36.19 
 
 		 567 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  34.2 
 
 		 509 aa  273  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  32.93 
 
 		 502 aa  270  5e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 		 504 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  33.05 
 
 		 506 aa  269  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 		 504 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  37.06 
 
 		 516 aa  266  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  34.19 
 
 		 489 aa  265  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  38.01 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  32.84 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  32.27 
 
 		 507 aa  260  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  38.39 
 
 		 526 aa  260  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  31.03 
 
 		 523 aa  260  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  36.33 
 
 		 511 aa  259  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  31.31 
 
 		 512 aa  259  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  37.26 
 
 		 507 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  35.24 
 
 		 498 aa  258  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  32.52 
 
 		 505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  32.66 
 
 		 505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  36.7 
 
 		 511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  39.12 
 
 		 508 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  36.54 
 
 		 511 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  32.52 
 
 		 505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  32.52 
 
 		 505 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  32.72 
 
 		 505 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  32.17 
 
 		 505 aa  253  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  37.82 
 
 		 518 aa  253  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  32.38 
 
 		 505 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  32.38 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  32.38 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  36.15 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  32.31 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  35.73 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  35.85 
 
 		 533 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  36.4 
 
 		 511 aa  251  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  35.96 
 
 		 510 aa  250  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  38.03 
 
 		 535 aa  249  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  37.71 
 
 		 508 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  33.48 
 
 		 506 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0796  histidine ammonia-lyase  40.65 
 
 		 506 aa  249  8e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  37.9 
 
 		 507 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  37.92 
 
 		 508 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  37.92 
 
 		 508 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2406  histidine ammonia-lyase  35.05 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  36.88 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  34.33 
 
 		 536 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  34.35 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  31.16 
 
 		 511 aa  248  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  34.43 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  38.17 
 
 		 514 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  33.54 
 
 		 511 aa  246  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  34.52 
 
 		 511 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  37.78 
 
 		 506 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  34.39 
 
 		 511 aa  246  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  36.97 
 
 		 518 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  36.18 
 
 		 513 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  36.18 
 
 		 513 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  36.18 
 
 		 513 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  34.35 
 
 		 519 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>