284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3917 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  62.4 
 
 
524 aa  641    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  62.92 
 
 
520 aa  661    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  66.15 
 
 
515 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  62.6 
 
 
524 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  100 
 
 
516 aa  1043    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  61.71 
 
 
520 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  67.38 
 
 
514 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  61.76 
 
 
517 aa  655    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  64.27 
 
 
511 aa  677    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  62.4 
 
 
524 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  62.4 
 
 
524 aa  641    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  61.51 
 
 
521 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  61.51 
 
 
521 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  62.38 
 
 
520 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  62.13 
 
 
519 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  61.99 
 
 
518 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  61.12 
 
 
521 aa  633  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  61.81 
 
 
524 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  60.93 
 
 
521 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  60.36 
 
 
520 aa  626  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  62.3 
 
 
528 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  61.97 
 
 
531 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  60.71 
 
 
528 aa  589  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  61.57 
 
 
531 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  61.54 
 
 
531 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  59.33 
 
 
532 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  60.44 
 
 
540 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  59.33 
 
 
532 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  60.64 
 
 
540 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  53.55 
 
 
511 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  43.11 
 
 
540 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  39.76 
 
 
506 aa  363  3e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  43.38 
 
 
715 aa  346  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  36.64 
 
 
511 aa  286  7e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  34.66 
 
 
502 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  35.86 
 
 
509 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  33.06 
 
 
516 aa  259  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  34.38 
 
 
498 aa  258  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  38.19 
 
 
508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  30.47 
 
 
513 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  33.26 
 
 
505 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  32.35 
 
 
508 aa  253  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  33.13 
 
 
507 aa  253  9.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  37.22 
 
 
526 aa  252  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  32.32 
 
 
509 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  33.55 
 
 
504 aa  251  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  33.55 
 
 
504 aa  251  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  33.93 
 
 
508 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  34.38 
 
 
505 aa  250  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  34.38 
 
 
505 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  31.52 
 
 
506 aa  249  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  34.38 
 
 
505 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  32.46 
 
 
506 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  34.13 
 
 
505 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  34.13 
 
 
505 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  34.38 
 
 
505 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  34.38 
 
 
505 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  34.13 
 
 
505 aa  248  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  34.36 
 
 
514 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  34.38 
 
 
505 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  34.52 
 
 
530 aa  246  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  30.74 
 
 
512 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  35.2 
 
 
506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  32.93 
 
 
507 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0175  histidine ammonia-lyase  33.84 
 
 
567 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  34.83 
 
 
535 aa  240  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1883  histidine ammonia-lyase  34.06 
 
 
552 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  33.48 
 
 
567 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  34.87 
 
 
533 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  35.04 
 
 
504 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  36.5 
 
 
507 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  34.05 
 
 
511 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0796  histidine ammonia-lyase  39.57 
 
 
506 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  37.77 
 
 
508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  35.85 
 
 
523 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  34.32 
 
 
511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  33.62 
 
 
511 aa  234  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  34.96 
 
 
509 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  32.6 
 
 
505 aa  234  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  33.46 
 
 
520 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  34.14 
 
 
519 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  33.68 
 
 
511 aa  232  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  35.44 
 
 
523 aa  233  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2406  histidine ammonia-lyase  33.55 
 
 
552 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  35.66 
 
 
516 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26290  histidine ammonia-lyase  35.83 
 
 
509 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 
511 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  29.89 
 
 
523 aa  229  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  34.44 
 
 
517 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  30.56 
 
 
497 aa  229  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  33.12 
 
 
510 aa  229  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  36.62 
 
 
534 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  35.12 
 
 
499 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  33.04 
 
 
512 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  37.44 
 
 
517 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  35.07 
 
 
518 aa  227  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  34.53 
 
 
506 aa  227  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 
515 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  31.6 
 
 
511 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  31.97 
 
 
506 aa  226  9e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>