284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3385 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  81.2 
 
 		 520 aa  890    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  80.81 
 
 		 519 aa  880    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  80.31 
 
 		 521 aa  870    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  61.99 
 
 		 516 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  81.93 
 
 		 524 aa  870    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  65.18 
 
 		 517 aa  692    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  66.27 
 
 		 511 aa  704    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  81.73 
 
 		 524 aa  870    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  81.73 
 
 		 520 aa  879    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  81.93 
 
 		 524 aa  872    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  80.58 
 
 		 521 aa  864    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  81.73 
 
 		 524 aa  870    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  80.78 
 
 		 521 aa  867    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  79.57 
 
 		 520 aa  854    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  81.73 
 
 		 524 aa  863    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  80.78 
 
 		 521 aa  867    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  80.62 
 
 		 520 aa  876    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 518 aa  1071    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  62.77 
 
 		 514 aa  632  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  61.12 
 
 		 515 aa  621  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  61.55 
 
 		 532 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  61.55 
 
 		 532 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  60.16 
 
 		 528 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  60.48 
 
 		 531 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  61.48 
 
 		 531 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  57.09 
 
 		 528 aa  581  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  60.88 
 
 		 531 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  58.78 
 
 		 540 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  58.78 
 
 		 540 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  53.2 
 
 		 511 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  43.07 
 
 		 540 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  41.34 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  40.54 
 
 		 715 aa  329  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  35.87 
 
 		 511 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  34.68 
 
 		 502 aa  282  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  34.94 
 
 		 508 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  33.67 
 
 		 516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  35.12 
 
 		 513 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  33.67 
 
 		 507 aa  269  8e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  36.46 
 
 		 509 aa  269  8e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  33.02 
 
 		 567 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  34.16 
 
 		 504 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  34.16 
 
 		 504 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  34 
 
 		 511 aa  263  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0175  histidine ammonia-lyase  36.34 
 
 		 567 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  34.07 
 
 		 508 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  32.81 
 
 		 506 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  32.48 
 
 		 509 aa  259  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  31.14 
 
 		 512 aa  257  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  35.26 
 
 		 526 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  35.41 
 
 		 498 aa  250  5e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  34.23 
 
 		 505 aa  249  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  34.38 
 
 		 505 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  35.36 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  32 
 
 		 507 aa  247  4e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  34.23 
 
 		 505 aa  247  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  34.23 
 
 		 505 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  34.23 
 
 		 505 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  34.23 
 
 		 505 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  34 
 
 		 505 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  34 
 
 		 505 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  32.82 
 
 		 520 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  34.23 
 
 		 505 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2406  histidine ammonia-lyase  32.51 
 
 		 552 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  34.78 
 
 		 506 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  34.35 
 
 		 533 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  34 
 
 		 505 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  35.25 
 
 		 489 aa  242  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1883  histidine ammonia-lyase  32.25 
 
 		 552 aa  239  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  34.75 
 
 		 535 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  33.68 
 
 		 508 aa  238  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  32.07 
 
 		 522 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  33.84 
 
 		 507 aa  233  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  34.5 
 
 		 513 aa  233  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  33.48 
 
 		 511 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0796  histidine ammonia-lyase  35.56 
 
 		 506 aa  232  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  33.56 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  32.58 
 
 		 511 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  32.34 
 
 		 536 aa  230  4e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 505 aa  230  4e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  32.79 
 
 		 511 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  34.64 
 
 		 511 aa  230  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  32.61 
 
 		 511 aa  229  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  33.86 
 
 		 511 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.14133 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03897  conserved hypothetical protein  32.14 
 
 		 686 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000679647  normal  0.349897 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  33.26 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  32.06 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  29.49 
 
 		 523 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  33.78 
 
 		 507 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  32.44 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  35.59 
 
 		 514 aa  227  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  32.44 
 
 		 512 aa  226  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  32.44 
 
 		 510 aa  226  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  34.23 
 
 		 517 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  32.18 
 
 		 510 aa  226  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  33.6 
 
 		 523 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  31.05 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  33.04 
 
 		 510 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  35.01 
 
 		 518 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>