285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2097 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  67 
 
 		 521 aa  704    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  62.28 
 
 		 515 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  62.82 
 
 		 514 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  67.13 
 
 		 520 aa  731    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  66.87 
 
 		 524 aa  705    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  83.07 
 
 		 517 aa  895    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  66.27 
 
 		 524 aa  696    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  67.4 
 
 		 521 aa  710    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  66.87 
 
 		 524 aa  706    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  67.79 
 
 		 521 aa  714    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  63.89 
 
 		 520 aa  686    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  66.4 
 
 		 519 aa  711    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  67.4 
 
 		 520 aa  726    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  67.26 
 
 		 521 aa  712    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  67.06 
 
 		 524 aa  707    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  67.59 
 
 		 520 aa  722    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  66.27 
 
 		 518 aa  704    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  64.27 
 
 		 516 aa  677    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 511 aa  1062    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  66.87 
 
 		 524 aa  703    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  60.36 
 
 		 531 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  59.49 
 
 		 531 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  58.96 
 
 		 531 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  59.56 
 
 		 540 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  57.85 
 
 		 528 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  59.56 
 
 		 540 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  58.17 
 
 		 532 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  58.17 
 
 		 532 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  54.22 
 
 		 528 aa  558  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  49.9 
 
 		 511 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  40.35 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  43.28 
 
 		 506 aa  352  8e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  40.84 
 
 		 715 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  39.78 
 
 		 511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  35.13 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  36.38 
 
 		 508 aa  280  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 509 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  37.86 
 
 		 502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  34.14 
 
 		 513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  35.52 
 
 		 505 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  34.65 
 
 		 516 aa  273  7e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  35.31 
 
 		 505 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  37.68 
 
 		 505 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  37.68 
 
 		 505 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  35.31 
 
 		 505 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  35.31 
 
 		 505 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  35.31 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  35.1 
 
 		 505 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  35.31 
 
 		 505 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  35.16 
 
 		 505 aa  270  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  35.84 
 
 		 506 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  34.67 
 
 		 505 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  36.12 
 
 		 509 aa  267  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  34.23 
 
 		 498 aa  265  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  32.28 
 
 		 507 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  34.56 
 
 		 514 aa  256  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  34.66 
 
 		 535 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  32.81 
 
 		 520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  34.04 
 
 		 511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  32.18 
 
 		 512 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  34 
 
 		 522 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  36.96 
 
 		 516 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  33.6 
 
 		 526 aa  252  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  32.61 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  33.55 
 
 		 567 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  33.85 
 
 		 489 aa  247  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  34.06 
 
 		 533 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  34.43 
 
 		 506 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  33.75 
 
 		 523 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  35.36 
 
 		 504 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  35.02 
 
 		 510 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0175  histidine ammonia-lyase  32.19 
 
 		 567 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  34.51 
 
 		 509 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 523 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  34.36 
 
 		 510 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  36.32 
 
 		 499 aa  239  8e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  32.67 
 
 		 511 aa  239  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  34.22 
 
 		 513 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  31.94 
 
 		 528 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  31.6 
 
 		 519 aa  238  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  33.61 
 
 		 511 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 		 497 aa  236  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  32.82 
 
 		 510 aa  236  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  33.91 
 
 		 513 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  32.84 
 
 		 506 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  32.94 
 
 		 530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  35.23 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  31.75 
 
 		 506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1883  histidine ammonia-lyase  33.26 
 
 		 552 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  31.29 
 
 		 509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 511 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  31.95 
 
 		 512 aa  234  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  31.4 
 
 		 523 aa  233  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  34.87 
 
 		 507 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  31.67 
 
 		 506 aa  233  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  32.46 
 
 		 515 aa  233  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 511 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  34.44 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>