286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5827 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  77.89 
 
 
513 aa  800    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  78.69 
 
 
513 aa  805    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  69.25 
 
 
523 aa  663    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  77.98 
 
 
507 aa  767    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  75.25 
 
 
507 aa  751    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  100 
 
 
510 aa  1009    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  68.15 
 
 
500 aa  658    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  94.51 
 
 
510 aa  942    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5619  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.78 
 
 
497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75216  normal  0.2633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1825  histidine ammonia-lyase  51.92 
 
 
549 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6593  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.88 
 
 
497 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.783722  normal  0.178286 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5747  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.88 
 
 
497 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6111  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.88 
 
 
497 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5836  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.35 
 
 
497 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  52.54 
 
 
534 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4838  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  51.72 
 
 
549 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6911  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  49.59 
 
 
495 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5918  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  48.45 
 
 
497 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  43.27 
 
 
507 aa  405  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0506  histidine ammonia-lyase  49.29 
 
 
495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  44 
 
 
511 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2586  histidine ammonia-lyase  51.88 
 
 
504 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206795  normal  0.158772 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
507 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  38.48 
 
 
516 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  42.21 
 
 
509 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  40.37 
 
 
508 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  42.16 
 
 
520 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4557  histidine ammonia-lyase  43.87 
 
 
524 aa  354  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.449486  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  45.11 
 
 
506 aa  354  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  40.82 
 
 
508 aa  352  7e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  43.79 
 
 
534 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  43.44 
 
 
514 aa  352  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  43.17 
 
 
506 aa  351  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0908  histidine ammonia-lyase  45.28 
 
 
497 aa  350  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  45.14 
 
 
517 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  46.26 
 
 
514 aa  346  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  39.57 
 
 
505 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  42.37 
 
 
510 aa  345  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  43.61 
 
 
510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  42.57 
 
 
513 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  42.57 
 
 
513 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  43.89 
 
 
515 aa  342  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  42.57 
 
 
513 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  42.11 
 
 
507 aa  342  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  42.57 
 
 
513 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  42.37 
 
 
513 aa  341  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  44.38 
 
 
499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  42.47 
 
 
510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  42.37 
 
 
513 aa  338  9e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  44.93 
 
 
508 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  38.46 
 
 
505 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  41.97 
 
 
513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  41.97 
 
 
513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  41.97 
 
 
513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  38.25 
 
 
505 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  41.27 
 
 
510 aa  337  3.9999999999999995e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  38.46 
 
 
505 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  38.25 
 
 
505 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  38.25 
 
 
506 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  42.92 
 
 
514 aa  336  7e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  38.03 
 
 
505 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  38.03 
 
 
505 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  38.03 
 
 
505 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  42.27 
 
 
510 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  38.25 
 
 
505 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  38.03 
 
 
505 aa  335  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  43.47 
 
 
518 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  41.14 
 
 
498 aa  335  2e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  41.42 
 
 
526 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 
512 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  42.06 
 
 
510 aa  333  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  44.18 
 
 
515 aa  333  5e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  41.24 
 
 
511 aa  333  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  42.17 
 
 
504 aa  333  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 
514 aa  332  9e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  45.19 
 
 
526 aa  331  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  41.24 
 
 
514 aa  331  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  40.66 
 
 
511 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  44.86 
 
 
509 aa  330  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  42.74 
 
 
507 aa  329  6e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  42.12 
 
 
516 aa  329  7e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  42.8 
 
 
507 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  40.37 
 
 
519 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  41.91 
 
 
515 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 
512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  40.41 
 
 
511 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  42.21 
 
 
507 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  41.82 
 
 
511 aa  326  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  41.53 
 
 
513 aa  326  5e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  41.1 
 
 
515 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  43.22 
 
 
507 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5905  histidine ammonia-lyase  42.8 
 
 
507 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2172  histidine ammonia-lyase  42.8 
 
 
507 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307198  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  43.65 
 
 
518 aa  325  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  43.03 
 
 
518 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  40.88 
 
 
536 aa  324  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  42.11 
 
 
507 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  41.51 
 
 
511 aa  325  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  40.93 
 
 
506 aa  323  4e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  40.93 
 
 
506 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>