285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0908 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0908  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
497 aa  992    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4557  histidine ammonia-lyase  58.86 
 
 
524 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.449486  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  46.22 
 
 
511 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  40 
 
 
516 aa  365  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  45.34 
 
 
509 aa  363  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  42.25 
 
 
507 aa  363  4e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  42.79 
 
 
498 aa  360  4e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  41.23 
 
 
507 aa  355  7.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  44.81 
 
 
520 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  45.28 
 
 
510 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  42.83 
 
 
513 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  42.7 
 
 
513 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  40.62 
 
 
508 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  44.78 
 
 
510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  46.14 
 
 
506 aa  336  3.9999999999999995e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  44.78 
 
 
516 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  43.13 
 
 
507 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  43.83 
 
 
500 aa  333  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  43.91 
 
 
506 aa  331  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  44.11 
 
 
523 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  39.35 
 
 
523 aa  322  8e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  41.89 
 
 
526 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  43.52 
 
 
504 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  44.39 
 
 
513 aa  315  9e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  39.55 
 
 
524 aa  315  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  45.45 
 
 
508 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  40.61 
 
 
536 aa  309  8e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  39.02 
 
 
508 aa  309  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  41.34 
 
 
507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  42.82 
 
 
511 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  41.27 
 
 
512 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 
514 aa  302  9e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  44.12 
 
 
508 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  41.63 
 
 
514 aa  300  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  44.17 
 
 
509 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  43.9 
 
 
508 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  38.03 
 
 
528 aa  299  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  43.9 
 
 
508 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  42.19 
 
 
534 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  40.69 
 
 
497 aa  298  1e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  40.56 
 
 
515 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  41.76 
 
 
510 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  42.5 
 
 
515 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  41.91 
 
 
511 aa  296  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  41.16 
 
 
513 aa  295  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  40.44 
 
 
518 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  38.41 
 
 
505 aa  295  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  41.32 
 
 
506 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  41.32 
 
 
506 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  41.32 
 
 
506 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  41.32 
 
 
506 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  40.13 
 
 
510 aa  294  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  42.52 
 
 
509 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  41.69 
 
 
511 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  40.95 
 
 
513 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  40.89 
 
 
510 aa  292  9e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  40.73 
 
 
513 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  40.08 
 
 
510 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  39.95 
 
 
506 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  42.33 
 
 
514 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  39.6 
 
 
519 aa  291  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  40.73 
 
 
513 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  40.7 
 
 
511 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  41.1 
 
 
506 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  40.73 
 
 
513 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  39.44 
 
 
522 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  41.3 
 
 
537 aa  290  6e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00727  histidine ammonia-lyase  44.79 
 
 
513 aa  289  7e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.396834  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  40.65 
 
 
511 aa  289  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  40.73 
 
 
513 aa  289  7e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  40.73 
 
 
513 aa  289  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  40.73 
 
 
513 aa  289  7e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 
511 aa  289  8e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  43.51 
 
 
526 aa  289  9e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  40.52 
 
 
513 aa  289  9e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  43.39 
 
 
518 aa  289  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  42.25 
 
 
534 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  41.99 
 
 
507 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  40.7 
 
 
513 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  37.5 
 
 
489 aa  287  4e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  41.26 
 
 
511 aa  286  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  42.31 
 
 
512 aa  286  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  36.63 
 
 
505 aa  286  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  40.5 
 
 
538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  39.6 
 
 
510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  41.88 
 
 
512 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  37.61 
 
 
497 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  44 
 
 
515 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  38.36 
 
 
503 aa  283  5.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  39.28 
 
 
510 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  40.22 
 
 
510 aa  283  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  38.69 
 
 
514 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 
507 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 
507 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 
529 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 
507 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  40.41 
 
 
507 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 
533 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 
529 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 
507 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>