286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0365 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  67.28 
 
 		 500 aa  650    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  82.42 
 
 		 513 aa  838    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  82.63 
 
 		 513 aa  834    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 507 aa  1028    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  76.05 
 
 		 507 aa  754    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  67.95 
 
 		 523 aa  654    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  76.36 
 
 		 510 aa  761    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  77.98 
 
 		 510 aa  781    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6911  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  49.49 
 
 		 495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5747  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.53 
 
 		 497 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6111  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.53 
 
 		 497 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5619  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  52.7 
 
 		 497 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75216  normal  0.2633 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6593  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.32 
 
 		 497 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.783722  normal  0.178286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1825  histidine ammonia-lyase  51.02 
 
 		 549 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5918  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  48.86 
 
 		 497 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5836  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  52.65 
 
 		 497 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  51.45 
 
 		 534 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4838  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  50.82 
 
 		 549 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0506  histidine ammonia-lyase  48.16 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  41.81 
 
 		 507 aa  411  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  43.76 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2586  histidine ammonia-lyase  48.55 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206795  normal  0.158772 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  39.76 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  40.76 
 
 		 508 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  42.57 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  40.08 
 
 		 507 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  44.25 
 
 		 534 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  43.71 
 
 		 506 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  44.18 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  43.17 
 
 		 517 aa  356  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  42.54 
 
 		 506 aa  356  5.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  42.07 
 
 		 510 aa  351  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  43.09 
 
 		 499 aa  349  6e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  42.08 
 
 		 526 aa  349  8e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  40.49 
 
 		 505 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  41.11 
 
 		 507 aa  346  7e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  43.99 
 
 		 514 aa  345  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  41.27 
 
 		 511 aa  344  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  40.82 
 
 		 513 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  40.45 
 
 		 498 aa  343  4e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  41.02 
 
 		 513 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  41.02 
 
 		 513 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  41.46 
 
 		 510 aa  343  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  41.02 
 
 		 513 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  41.57 
 
 		 513 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  39.87 
 
 		 508 aa  342  9e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  41.46 
 
 		 510 aa  342  9e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0908  histidine ammonia-lyase  43.13 
 
 		 497 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  40.44 
 
 		 514 aa  341  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  42.56 
 
 		 510 aa  341  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  41.26 
 
 		 510 aa  341  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  39.13 
 
 		 505 aa  340  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  39.48 
 
 		 520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  39.76 
 
 		 511 aa  339  5.9999999999999996e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  42.52 
 
 		 519 aa  339  7e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  41.92 
 
 		 537 aa  339  9e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  41.63 
 
 		 512 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  40.62 
 
 		 513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  41.55 
 
 		 515 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  42.29 
 
 		 514 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  38.7 
 
 		 505 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  38.7 
 
 		 505 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  38.7 
 
 		 505 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  40.62 
 
 		 513 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  40.62 
 
 		 513 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  40.62 
 
 		 513 aa  336  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  39.15 
 
 		 509 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  38.7 
 
 		 506 aa  336  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4557  histidine ammonia-lyase  40.38 
 
 		 524 aa  335  7.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.449486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  38.48 
 
 		 505 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  38.48 
 
 		 505 aa  335  9e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  38.48 
 
 		 505 aa  335  9e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  38.48 
 
 		 505 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  38.7 
 
 		 505 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  39.23 
 
 		 538 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  43.33 
 
 		 509 aa  332  7.000000000000001e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  41.3 
 
 		 511 aa  332  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  41.99 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  41.19 
 
 		 515 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  38.74 
 
 		 511 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  41.24 
 
 		 514 aa  330  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  40.5 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  41.38 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  40.28 
 
 		 511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  41.67 
 
 		 509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  42.25 
 
 		 504 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  39.83 
 
 		 510 aa  327  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  41.6 
 
 		 507 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  41.4 
 
 		 510 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  41.22 
 
 		 514 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  39.43 
 
 		 510 aa  325  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  41.4 
 
 		 510 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  39.75 
 
 		 513 aa  324  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  42.58 
 
 		 518 aa  323  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  39.58 
 
 		 514 aa  323  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  41.4 
 
 		 510 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67320  histidine ammonia-lyase  42.04 
 
 		 509 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  37.35 
 
 		 523 aa  322  8e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  43.23 
 
 		 518 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>