285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0254 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  71.12 
 
 
514 aa  696    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
517 aa  1009    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  68.07 
 
 
530 aa  662    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  69.73 
 
 
514 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  71.51 
 
 
534 aa  678    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  70.86 
 
 
537 aa  679    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  68.26 
 
 
530 aa  665    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  71.84 
 
 
515 aa  687    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  67.55 
 
 
533 aa  648    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  68.55 
 
 
526 aa  622  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  67.5 
 
 
518 aa  605  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  69.72 
 
 
503 aa  588  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  59.77 
 
 
517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  63.55 
 
 
544 aa  584  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  65.48 
 
 
514 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  59.18 
 
 
512 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  60.36 
 
 
509 aa  539  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  58.79 
 
 
512 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  66.14 
 
 
514 aa  529  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  50.1 
 
 
513 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  51.11 
 
 
506 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  42.29 
 
 
507 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  47.94 
 
 
506 aa  405  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  44.29 
 
 
511 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  45.12 
 
 
509 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  44.31 
 
 
508 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  46.21 
 
 
520 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  43.7 
 
 
507 aa  397  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  41.67 
 
 
516 aa  391  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  43.27 
 
 
505 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  41.57 
 
 
489 aa  383  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  45.93 
 
 
498 aa  374  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  43.37 
 
 
510 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  44.31 
 
 
510 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  43.84 
 
 
512 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  43.55 
 
 
510 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  45.24 
 
 
515 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  46.35 
 
 
499 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  43.38 
 
 
511 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  43.69 
 
 
511 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  42.22 
 
 
510 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  43.46 
 
 
510 aa  365  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  43.58 
 
 
514 aa  363  6e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  44.4 
 
 
526 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  44.29 
 
 
533 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  42.5 
 
 
510 aa  360  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  42.66 
 
 
513 aa  360  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  42.77 
 
 
497 aa  359  6e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  42.46 
 
 
513 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  42.46 
 
 
513 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  42.46 
 
 
513 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  42.47 
 
 
513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  42.43 
 
 
513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  41.99 
 
 
513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  51.24 
 
 
508 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  49.68 
 
 
508 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  44.27 
 
 
510 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  41.99 
 
 
513 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  41.99 
 
 
513 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  41.99 
 
 
513 aa  355  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  48.53 
 
 
508 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  43.31 
 
 
511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  48.84 
 
 
508 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  42.14 
 
 
511 aa  353  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  42.45 
 
 
524 aa  352  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  39.75 
 
 
523 aa  352  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  43.17 
 
 
507 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 
513 aa  350  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  45.08 
 
 
497 aa  348  1e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  42.24 
 
 
507 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  44.14 
 
 
516 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  41.57 
 
 
511 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 
515 aa  348  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  43.51 
 
 
507 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  41.12 
 
 
509 aa  347  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  44.27 
 
 
510 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  45.13 
 
 
507 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  43.1 
 
 
522 aa  346  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  44.93 
 
 
529 aa  346  7e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  44.93 
 
 
533 aa  346  7e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  44.93 
 
 
529 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  43.12 
 
 
515 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  44.93 
 
 
507 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  44.93 
 
 
507 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  42.92 
 
 
511 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  44.93 
 
 
507 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  45.24 
 
 
517 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  42.08 
 
 
508 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  42.57 
 
 
515 aa  343  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  44.72 
 
 
514 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 
507 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  41.89 
 
 
528 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  42.69 
 
 
518 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  42.18 
 
 
503 aa  342  1e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 
507 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  42.65 
 
 
507 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2935  histidine ammonia-lyase  42.8 
 
 
507 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  41.23 
 
 
536 aa  341  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  39.8 
 
 
505 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  43.43 
 
 
514 aa  340  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>