286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2576 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
523 aa  1071    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  67.27 
 
 
503 aa  696    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  57.58 
 
 
497 aa  594  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  48.15 
 
 
522 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  46.53 
 
 
516 aa  442  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  45.9 
 
 
508 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  45 
 
 
507 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  51.68 
 
 
508 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  46.9 
 
 
497 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  46.04 
 
 
507 aa  426  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  44.25 
 
 
511 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  45.51 
 
 
528 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  45.29 
 
 
506 aa  425  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 
505 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 
505 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 
506 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 
505 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
505 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
505 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  45.59 
 
 
506 aa  418  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
505 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  42.94 
 
 
505 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
505 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
505 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  43.7 
 
 
508 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  44.77 
 
 
508 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  43.17 
 
 
509 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  41.45 
 
 
513 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  42.94 
 
 
520 aa  405  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  45.03 
 
 
515 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  44.58 
 
 
508 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  42.48 
 
 
504 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  44.38 
 
 
508 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  42.48 
 
 
504 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  44.49 
 
 
511 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  44.69 
 
 
513 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  45.47 
 
 
511 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  43.58 
 
 
489 aa  392  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  43.74 
 
 
526 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  42.49 
 
 
511 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  42.62 
 
 
508 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  44.22 
 
 
513 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  43.98 
 
 
513 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  44.22 
 
 
513 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1689  histidine ammonia-lyase  45.95 
 
 
509 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  43.92 
 
 
514 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  40.84 
 
 
518 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  44.25 
 
 
513 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  43.26 
 
 
509 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  44.89 
 
 
510 aa  385  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  44.56 
 
 
512 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  43.71 
 
 
538 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  44.22 
 
 
513 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 
513 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  45.49 
 
 
510 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  44.15 
 
 
509 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  42.62 
 
 
504 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  44.82 
 
 
498 aa  382  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  41.6 
 
 
516 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
513 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
513 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
513 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  45.53 
 
 
510 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  44.27 
 
 
515 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  46.54 
 
 
514 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  45.08 
 
 
518 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  45.52 
 
 
517 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  45.09 
 
 
510 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  43.74 
 
 
510 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  42.06 
 
 
507 aa  378  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  42.5 
 
 
511 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  43.7 
 
 
511 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  42.18 
 
 
514 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00727  histidine ammonia-lyase  44.83 
 
 
513 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.396834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  41.29 
 
 
507 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  39.88 
 
 
511 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  42.18 
 
 
511 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
505 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  43.96 
 
 
518 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1653  histidine ammonia-lyase  43.07 
 
 
513 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129126  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  44.32 
 
 
506 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  44.32 
 
 
506 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  44.32 
 
 
506 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  44.32 
 
 
506 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  44.03 
 
 
499 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  44.72 
 
 
518 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  43 
 
 
510 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  44.32 
 
 
506 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
514 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 
515 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  43.29 
 
 
506 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  43.29 
 
 
506 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 
515 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  45.5 
 
 
510 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  42.33 
 
 
511 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  41.63 
 
 
509 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  42.41 
 
 
507 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  41.21 
 
 
506 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  41.58 
 
 
519 aa  368  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>