286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2730 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 499 aa  978    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  64.86 
 
 		 506 aa  578  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  63.86 
 
 		 506 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  52.65 
 
 		 507 aa  503  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  52.63 
 
 		 509 aa  484  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  51.63 
 
 		 511 aa  476  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  49.7 
 
 		 508 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  53.51 
 
 		 520 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  51.58 
 
 		 505 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  50.1 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  50.31 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  50.1 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  50.1 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  51.58 
 
 		 505 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  51.37 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  51.37 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  51.37 
 
 		 506 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  51.37 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  47.34 
 
 		 507 aa  458  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  51.79 
 
 		 508 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  46.33 
 
 		 516 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  50.74 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  52.35 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  53.81 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  52.65 
 
 		 507 aa  450  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  51.12 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  47.93 
 
 		 505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  51.59 
 
 		 514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  50.73 
 
 		 517 aa  445  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  46.44 
 
 		 489 aa  445  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00727  histidine ammonia-lyase  54.07 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.396834  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  54.45 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  50.92 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  55.32 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  54.41 
 
 		 515 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  49.69 
 
 		 518 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  51.07 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  49.7 
 
 		 526 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  46.83 
 
 		 511 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  45.23 
 
 		 498 aa  434  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  55.32 
 
 		 508 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0149  histidine ammonia-lyase  48.88 
 
 		 523 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  55.32 
 
 		 508 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1689  histidine ammonia-lyase  52.95 
 
 		 509 aa  431  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  47.35 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  48.12 
 
 		 504 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  52.94 
 
 		 504 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  46.42 
 
 		 511 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  47.78 
 
 		 511 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  47.54 
 
 		 510 aa  428  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  47.62 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2855  histidine ammonia-lyase  48.87 
 
 		 522 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  51.52 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  47.13 
 
 		 510 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  48.12 
 
 		 504 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  48.99 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  47.34 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2716  histidine ammonia-lyase  49.28 
 
 		 526 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  47.01 
 
 		 510 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  46.93 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  46.93 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  47.69 
 
 		 510 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  46.93 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  46.93 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  46.93 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1653  histidine ammonia-lyase  52.98 
 
 		 513 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129126  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  45.21 
 
 		 528 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  46.93 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  48.37 
 
 		 507 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  45.91 
 
 		 514 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  48.5 
 
 		 514 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  46.93 
 
 		 513 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  51.11 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  45.66 
 
 		 510 aa  422  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  45.45 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  45.95 
 
 		 514 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  48.06 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  48.38 
 
 		 518 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  44.06 
 
 		 506 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  47.62 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  50 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  46.31 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  46.84 
 
 		 506 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  44.06 
 
 		 506 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  48.68 
 
 		 518 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  47.94 
 
 		 515 aa  415  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  46.01 
 
 		 506 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  46.84 
 
 		 506 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  46.84 
 
 		 506 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  46.84 
 
 		 506 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  47.82 
 
 		 510 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  49.7 
 
 		 508 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  45.31 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  48.66 
 
 		 529 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  48.87 
 
 		 514 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  46.57 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  48.87 
 
 		 507 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  48.66 
 
 		 507 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  48.13 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  48.66 
 
 		 533 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>