286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4557 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4557  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
524 aa  1064    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.449486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0908  histidine ammonia-lyase  58.86 
 
 
497 aa  521  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  42.44 
 
 
511 aa  378  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  42.5 
 
 
513 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  43.87 
 
 
510 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  43.25 
 
 
520 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  40.17 
 
 
516 aa  356  5e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  43.48 
 
 
510 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 
513 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  37.68 
 
 
507 aa  353  2.9999999999999997e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  41.09 
 
 
509 aa  350  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  38.26 
 
 
508 aa  350  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  41.55 
 
 
498 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  40.38 
 
 
507 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  39.08 
 
 
507 aa  336  5e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  41.12 
 
 
500 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  40.2 
 
 
523 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  41.52 
 
 
507 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  39.06 
 
 
504 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  37.15 
 
 
523 aa  331  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  41.49 
 
 
516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  42.16 
 
 
506 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  41.41 
 
 
506 aa  325  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  38.74 
 
 
524 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  39.37 
 
 
528 aa  319  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  40.82 
 
 
499 aa  317  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  39.7 
 
 
518 aa  316  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  38.46 
 
 
522 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  38.34 
 
 
526 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  39.53 
 
 
513 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  37.45 
 
 
519 aa  313  6.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  40.2 
 
 
514 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  40.61 
 
 
514 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  38.97 
 
 
515 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  38.14 
 
 
514 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  36.33 
 
 
538 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  38.48 
 
 
513 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 
509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  38.37 
 
 
517 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  35.02 
 
 
508 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  35.19 
 
 
505 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  38 
 
 
506 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  37.58 
 
 
489 aa  302  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  37.65 
 
 
511 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  36.93 
 
 
511 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  34.98 
 
 
505 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  38.03 
 
 
510 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  40.41 
 
 
509 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4104  histidine ammonia-lyase  38.24 
 
 
563 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  39.59 
 
 
514 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  34.98 
 
 
505 aa  301  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  36.97 
 
 
510 aa  301  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  34.98 
 
 
505 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  37.33 
 
 
528 aa  300  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2855  histidine ammonia-lyase  39.56 
 
 
522 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288537  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  40.38 
 
 
508 aa  300  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  34.98 
 
 
505 aa  300  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  34.98 
 
 
505 aa  299  8e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  36.42 
 
 
511 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  34.57 
 
 
506 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  37.68 
 
 
497 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  34.77 
 
 
505 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  34.77 
 
 
505 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  38.73 
 
 
536 aa  297  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  34.77 
 
 
505 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  37.76 
 
 
506 aa  297  3e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  34.57 
 
 
505 aa  297  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  36.74 
 
 
512 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  36.93 
 
 
505 aa  296  5e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 
537 aa  296  6e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  37.37 
 
 
507 aa  296  6e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  36.83 
 
 
514 aa  296  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  38.84 
 
 
520 aa  296  8e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  39.7 
 
 
518 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  37.82 
 
 
513 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  37.39 
 
 
513 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  36 
 
 
506 aa  295  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  37.61 
 
 
513 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  37.61 
 
 
513 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  37.39 
 
 
513 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  36.48 
 
 
510 aa  293  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  37.17 
 
 
506 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  36.75 
 
 
510 aa  293  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  37.17 
 
 
506 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1264  histidine ammonia-lyase  40.76 
 
 
518 aa  292  8e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  41.61 
 
 
515 aa  292  9e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  37.17 
 
 
506 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  37.18 
 
 
510 aa  292  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  37.17 
 
 
506 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  36.08 
 
 
511 aa  292  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  35.77 
 
 
497 aa  291  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  36.95 
 
 
513 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  35.66 
 
 
509 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  36.07 
 
 
511 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2716  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
526 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  38.62 
 
 
511 aa  291  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  41.23 
 
 
534 aa  290  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  37.18 
 
 
513 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  37.18 
 
 
513 aa  289  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  35.74 
 
 
510 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>