285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0324 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
497 aa  1025    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  57.58 
 
 
523 aa  594  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  56.39 
 
 
503 aa  555  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  46.67 
 
 
497 aa  438  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  44.47 
 
 
516 aa  433  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  48.5 
 
 
507 aa  430  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  49.55 
 
 
522 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  45.96 
 
 
508 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  43.64 
 
 
528 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  42.92 
 
 
507 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  44.81 
 
 
511 aa  394  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  50.33 
 
 
508 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 
509 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  45.4 
 
 
506 aa  392  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  43.44 
 
 
508 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  39.84 
 
 
504 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  46.24 
 
 
526 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  39.84 
 
 
504 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  44.74 
 
 
506 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  44.06 
 
 
520 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  44.19 
 
 
498 aa  376  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 
513 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  40.25 
 
 
505 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 
513 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 
513 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  42.21 
 
 
505 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
513 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  42.21 
 
 
505 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  45.47 
 
 
516 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  42.21 
 
 
505 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 
513 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  41.99 
 
 
506 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  41.99 
 
 
505 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 
513 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  41.99 
 
 
505 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  42.12 
 
 
505 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  41.9 
 
 
505 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  43.39 
 
 
511 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  41.9 
 
 
505 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
513 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
513 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
513 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  42.94 
 
 
510 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  42.54 
 
 
510 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  44.14 
 
 
489 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  41.99 
 
 
505 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  44.15 
 
 
504 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  43.46 
 
 
511 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
510 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  41.32 
 
 
512 aa  362  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  41.94 
 
 
528 aa  360  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  42.33 
 
 
510 aa  361  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  42.51 
 
 
514 aa  361  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  44.92 
 
 
508 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  40.92 
 
 
514 aa  359  5e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  41.46 
 
 
538 aa  359  6e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  44.92 
 
 
508 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  41.98 
 
 
515 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  43.71 
 
 
513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  44.99 
 
 
508 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  41.25 
 
 
510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  42.06 
 
 
511 aa  356  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  43.62 
 
 
511 aa  355  6.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  40.29 
 
 
509 aa  354  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  43.4 
 
 
511 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  43.43 
 
 
507 aa  355  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  40.45 
 
 
519 aa  352  7e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  43.62 
 
 
515 aa  352  8.999999999999999e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1160  histidine ammonia-lyase  42.21 
 
 
544 aa  351  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480862  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  44.52 
 
 
512 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  43.4 
 
 
513 aa  351  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  42.63 
 
 
511 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  41.1 
 
 
514 aa  350  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  41.38 
 
 
505 aa  350  3e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1653  histidine ammonia-lyase  43.78 
 
 
513 aa  349  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129126  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  40.64 
 
 
534 aa  349  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  43.07 
 
 
506 aa  349  7e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  42.68 
 
 
507 aa  349  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  42.22 
 
 
511 aa  349  8e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 
518 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  40.4 
 
 
511 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  40.82 
 
 
514 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  45.67 
 
 
499 aa  348  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1689  histidine ammonia-lyase  43.05 
 
 
509 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  41.3 
 
 
515 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  43.07 
 
 
506 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  42.68 
 
 
507 aa  347  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  42.04 
 
 
509 aa  347  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  42.2 
 
 
509 aa  347  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  41.24 
 
 
511 aa  346  5e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  42.41 
 
 
518 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  40.93 
 
 
511 aa  345  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  41.39 
 
 
507 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  41.56 
 
 
506 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  40.7 
 
 
514 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  42.77 
 
 
507 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  41.39 
 
 
508 aa  344  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  42.22 
 
 
511 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  42.57 
 
 
518 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  40.54 
 
 
507 aa  343  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.36207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>