285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1335 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 528 aa  1087    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  57.61 
 
 		 522 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  54.49 
 
 		 497 aa  538  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  51.35 
 
 		 508 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  49.18 
 
 		 506 aa  450  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  46.9 
 
 		 516 aa  442  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  46.9 
 
 		 507 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  47.67 
 
 		 506 aa  442  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  45.26 
 
 		 511 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  45.51 
 
 		 523 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  44.18 
 
 		 509 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  43.64 
 
 		 497 aa  417  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  44.15 
 
 		 508 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  44.33 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  44.93 
 
 		 510 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  45.8 
 
 		 520 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  42.48 
 
 		 507 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  45.17 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  44.2 
 
 		 512 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  43.16 
 
 		 506 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  46.58 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  44.65 
 
 		 511 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  43.51 
 
 		 514 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  44.2 
 
 		 510 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  43.44 
 
 		 513 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  43.6 
 
 		 507 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  43.59 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  44.47 
 
 		 510 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  43.24 
 
 		 513 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  41.9 
 
 		 510 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  43.03 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  43.65 
 
 		 513 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  43.03 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  41.75 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  43.24 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  45.61 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  41.75 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  41.75 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  41.2 
 
 		 511 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  43.44 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  43.44 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  44.51 
 
 		 510 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  42.1 
 
 		 526 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  43.44 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  43.83 
 
 		 510 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  41.75 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 		 507 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  41.7 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  46.24 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  41.37 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  46.24 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  46.02 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  41.57 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  44.71 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  42.28 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  41.7 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  42.62 
 
 		 510 aa  391  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  45.21 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  46.02 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  42.28 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  41.55 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  42.08 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  41.75 
 
 		 510 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  46.02 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  46.02 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  46.02 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  47.13 
 
 		 508 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  47.13 
 
 		 508 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  45.8 
 
 		 505 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  46.02 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  47.13 
 
 		 508 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  43.63 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  46.02 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  45.8 
 
 		 505 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  43.08 
 
 		 511 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  42.24 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  45.43 
 
 		 511 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  40.89 
 
 		 510 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  43.28 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  39.84 
 
 		 507 aa  381  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  43.2 
 
 		 518 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  41.28 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5831  histidine ammonia-lyase  44.12 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  44.69 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  43.66 
 
 		 517 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67320  histidine ammonia-lyase  42.83 
 
 		 509 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  44.99 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0077  histidine ammonia-lyase  42.7 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  41.28 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  41.28 
 
 		 529 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  41.28 
 
 		 529 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1689  histidine ammonia-lyase  44.37 
 
 		 509 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5905  histidine ammonia-lyase  42.48 
 
 		 507 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  41.19 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4085  histidine ammonia-lyase  42.7 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  41.28 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4137  histidine ammonia-lyase  42.7 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0926785  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  41.28 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2172  histidine ammonia-lyase  42.48 
 
 		 507 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  42.13 
 
 		 511 aa  379  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>