286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5274 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 513 aa  1037    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  92.98 
 
 		 513 aa  972    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  82.42 
 
 		 507 aa  818    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  67.41 
 
 		 523 aa  661    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  78.02 
 
 		 507 aa  770    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  65.24 
 
 		 500 aa  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  77.89 
 
 		 510 aa  793    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  77.29 
 
 		 510 aa  775    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5619  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.07 
 
 		 497 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75216  normal  0.2633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1825  histidine ammonia-lyase  51.42 
 
 		 549 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5747  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.11 
 
 		 497 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6593  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  52.9 
 
 		 497 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.783722  normal  0.178286 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5836  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.25 
 
 		 497 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6111  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.11 
 
 		 497 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  52.17 
 
 		 534 aa  445  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6911  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  49.79 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5918  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  49.06 
 
 		 497 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4838  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  50.81 
 
 		 549 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0506  histidine ammonia-lyase  47.96 
 
 		 495 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  41.84 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2586  histidine ammonia-lyase  48.96 
 
 		 504 aa  402  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206795  normal  0.158772 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  43.76 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  43.11 
 
 		 509 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  41.07 
 
 		 508 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  39 
 
 		 516 aa  385  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  40.25 
 
 		 507 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  45.07 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  44.49 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4557  histidine ammonia-lyase  42.5 
 
 		 524 aa  360  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.449486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  40.78 
 
 		 505 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  39.46 
 
 		 505 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  40.96 
 
 		 508 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  44.63 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  41.77 
 
 		 520 aa  352  7e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  39.04 
 
 		 505 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  39.61 
 
 		 505 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  39.04 
 
 		 506 aa  351  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  39.25 
 
 		 505 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  39.61 
 
 		 505 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  38.83 
 
 		 505 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  38.83 
 
 		 505 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  38.83 
 
 		 505 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 		 534 aa  349  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  42.48 
 
 		 514 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  38.97 
 
 		 505 aa  346  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  42.02 
 
 		 526 aa  345  8e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  43.63 
 
 		 504 aa  340  5e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0908  histidine ammonia-lyase  42.7 
 
 		 497 aa  339  7e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  41.31 
 
 		 519 aa  339  8e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  41.67 
 
 		 514 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 		 507 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  42.15 
 
 		 508 aa  333  5e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  38.9 
 
 		 498 aa  330  3e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  41.93 
 
 		 510 aa  330  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  41.51 
 
 		 510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  42.08 
 
 		 517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  38.96 
 
 		 538 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  42.48 
 
 		 514 aa  327  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  40.08 
 
 		 511 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  41.3 
 
 		 510 aa  327  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  42.43 
 
 		 515 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  39.7 
 
 		 514 aa  326  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 		 513 aa  326  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 		 518 aa  326  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  39.04 
 
 		 506 aa  326  6e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  41.84 
 
 		 506 aa  326  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  41.09 
 
 		 510 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  41.28 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  39.75 
 
 		 511 aa  324  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 		 510 aa  324  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  40.59 
 
 		 512 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  35.89 
 
 		 504 aa  323  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  35.89 
 
 		 504 aa  323  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 		 536 aa  323  5e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  40.66 
 
 		 507 aa  323  5e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  39.03 
 
 		 506 aa  323  6e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  37.9 
 
 		 524 aa  322  8e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  40.33 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 		 507 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  40.33 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  41.39 
 
 		 515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  40.92 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  40.25 
 
 		 511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  39.12 
 
 		 511 aa  320  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  40.08 
 
 		 515 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  41.77 
 
 		 507 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  38.49 
 
 		 509 aa  320  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  39.41 
 
 		 513 aa  320  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 		 506 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 		 506 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  40.25 
 
 		 513 aa  320  6e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 		 507 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  40.25 
 
 		 513 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 		 518 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  41.11 
 
 		 516 aa  319  7.999999999999999e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  40.26 
 
 		 518 aa  319  7.999999999999999e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  39.12 
 
 		 514 aa  319  9e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  40.46 
 
 		 513 aa  319  9e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 		 507 aa  319  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  42.15 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>