285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1777 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  65.58 
 
 
489 aa  673    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
505 aa  1026    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  51.62 
 
 
498 aa  464  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  51.88 
 
 
508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  48.79 
 
 
516 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  45.95 
 
 
520 aa  442  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  45.79 
 
 
507 aa  419  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  47.12 
 
 
511 aa  419  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  44.63 
 
 
508 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  48.56 
 
 
516 aa  421  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  44.47 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  44.47 
 
 
505 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  46.69 
 
 
504 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  44.17 
 
 
506 aa  415  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  44.26 
 
 
505 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  44.26 
 
 
505 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  44.26 
 
 
505 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  44.26 
 
 
505 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  43.65 
 
 
505 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  47.93 
 
 
499 aa  415  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  44.26 
 
 
505 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  44.47 
 
 
505 aa  415  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  43.85 
 
 
505 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  45.17 
 
 
509 aa  411  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  44.73 
 
 
509 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  45.87 
 
 
506 aa  405  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  45.73 
 
 
506 aa  405  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  44.35 
 
 
510 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  43.98 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  41.95 
 
 
538 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  42.48 
 
 
511 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  43.61 
 
 
507 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  44.7 
 
 
512 aa  398  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  43.41 
 
 
510 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  42.95 
 
 
511 aa  395  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  42.6 
 
 
511 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  43.66 
 
 
513 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  43.45 
 
 
513 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  43.45 
 
 
513 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  43.66 
 
 
513 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  43.52 
 
 
514 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  43.45 
 
 
513 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  43 
 
 
510 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  44.98 
 
 
508 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  41.94 
 
 
509 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  42.39 
 
 
510 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  44.98 
 
 
508 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  42.3 
 
 
510 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  42.31 
 
 
514 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  44.98 
 
 
508 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  42.42 
 
 
511 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  43.27 
 
 
513 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  43.27 
 
 
513 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  43.27 
 
 
513 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 
519 aa  385  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  44.47 
 
 
518 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  43.45 
 
 
513 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  41.99 
 
 
515 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  42.3 
 
 
507 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  42.94 
 
 
507 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  42.06 
 
 
511 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  46.39 
 
 
514 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  42.59 
 
 
510 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  47.05 
 
 
515 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  41.89 
 
 
510 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  43.83 
 
 
513 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 
513 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  41.25 
 
 
510 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  42.39 
 
 
514 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  42.3 
 
 
511 aa  382  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  42.8 
 
 
534 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  42.62 
 
 
510 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  45.01 
 
 
517 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  42.83 
 
 
506 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  41.31 
 
 
518 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  41.41 
 
 
515 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  41.38 
 
 
511 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  41.56 
 
 
514 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  41.89 
 
 
506 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  43.27 
 
 
507 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  42.83 
 
 
506 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  42.62 
 
 
506 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  42.27 
 
 
511 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  42.01 
 
 
506 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  42.24 
 
 
510 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  41.68 
 
 
515 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  42.64 
 
 
506 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 
506 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
512 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  41.04 
 
 
514 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  43.27 
 
 
517 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  43.27 
 
 
507 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 
528 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  41.35 
 
 
536 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
523 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  44.49 
 
 
530 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 
512 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 
513 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  42.44 
 
 
510 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  42.62 
 
 
506 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>