285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0336 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  99.43 
 
 		 524 aa  1079    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  92.56 
 
 		 521 aa  1009    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  85.43 
 
 		 520 aa  909    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  86.02 
 
 		 520 aa  929    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  99.62 
 
 		 524 aa  1083    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  99.43 
 
 		 524 aa  1082    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  63.39 
 
 		 514 aa  643    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  62.6 
 
 		 516 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 524 aa  1086    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  65.54 
 
 		 517 aa  696    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  95.27 
 
 		 521 aa  1011    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  92.56 
 
 		 521 aa  1009    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  86.22 
 
 		 520 aa  920    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  67.06 
 
 		 511 aa  707    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  98.09 
 
 		 524 aa  1066    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  92.94 
 
 		 521 aa  1010    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  85.83 
 
 		 520 aa  925    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  81.93 
 
 		 518 aa  872    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  86.41 
 
 		 519 aa  927    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  60.87 
 
 		 515 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  58.17 
 
 		 528 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  57.09 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  57.09 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  57.54 
 
 		 528 aa  579  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  59.16 
 
 		 531 aa  581  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  58.96 
 
 		 531 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  57.67 
 
 		 532 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  58.96 
 
 		 531 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  57.67 
 
 		 532 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  54 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  41.85 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  42.78 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  40.34 
 
 		 715 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  38.29 
 
 		 511 aa  286  8e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  34.11 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  34.14 
 
 		 508 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  36.19 
 
 		 502 aa  270  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  34.79 
 
 		 516 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  33.75 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  33.75 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  33.52 
 
 		 567 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  33.88 
 
 		 507 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  35.23 
 
 		 509 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  35.43 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  34.38 
 
 		 507 aa  258  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  31.94 
 
 		 509 aa  256  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  34.55 
 
 		 520 aa  253  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  31.14 
 
 		 512 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  35.85 
 
 		 505 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  35.98 
 
 		 516 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  33.54 
 
 		 511 aa  250  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  32.39 
 
 		 506 aa  251  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  35.1 
 
 		 511 aa  249  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  35.1 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  36.91 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  34.85 
 
 		 511 aa  248  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  34.27 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2406  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0175  histidine ammonia-lyase  35.29 
 
 		 567 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  34.14 
 
 		 505 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  34.6 
 
 		 511 aa  246  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  33.41 
 
 		 505 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  33.41 
 
 		 505 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  33.6 
 
 		 508 aa  244  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  33.71 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  33.92 
 
 		 505 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  33.92 
 
 		 505 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  33.84 
 
 		 506 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  33.7 
 
 		 505 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  33.7 
 
 		 505 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  34.08 
 
 		 511 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  34.45 
 
 		 505 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  36.7 
 
 		 526 aa  243  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  35.07 
 
 		 511 aa  243  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  35.07 
 
 		 511 aa  240  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  34.58 
 
 		 514 aa  237  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  33.56 
 
 		 509 aa  237  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1883  histidine ammonia-lyase  33.74 
 
 		 552 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  32.9 
 
 		 504 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  35.29 
 
 		 512 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  33.27 
 
 		 533 aa  233  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  33 
 
 		 507 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  32.99 
 
 		 513 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  32.72 
 
 		 506 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  35.32 
 
 		 518 aa  230  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  31.33 
 
 		 511 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  32.48 
 
 		 523 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  31.54 
 
 		 530 aa  229  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  32.97 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  34.73 
 
 		 513 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  33.47 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  32.92 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  29.86 
 
 		 528 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4557  histidine ammonia-lyase  35.14 
 
 		 524 aa  227  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.449486  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  33.49 
 
 		 505 aa  227  4e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0149  histidine ammonia-lyase  34.78 
 
 		 523 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  32.06 
 
 		 507 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  30.79 
 
 		 507 aa  226  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>