285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3604 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  73.26 
 
 		 528 aa  760    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  76.41 
 
 		 532 aa  780    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  77.32 
 
 		 531 aa  808    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  76.41 
 
 		 532 aa  780    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  98.33 
 
 		 540 aa  1065    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 540 aa  1087    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  76.94 
 
 		 531 aa  805    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  77.74 
 
 		 531 aa  785    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  62.45 
 
 		 514 aa  601  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  59.56 
 
 		 511 aa  592  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  59.32 
 
 		 517 aa  595  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  61.45 
 
 		 515 aa  591  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  58.45 
 
 		 520 aa  589  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  57.09 
 
 		 524 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  57.28 
 
 		 524 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  57.09 
 
 		 524 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  57.09 
 
 		 524 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  57.65 
 
 		 520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  58.25 
 
 		 521 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  59 
 
 		 520 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  58.2 
 
 		 520 aa  581  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  57.4 
 
 		 521 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  58.13 
 
 		 524 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  58.05 
 
 		 521 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  57.65 
 
 		 521 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  56.27 
 
 		 519 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  58.78 
 
 		 518 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  60.64 
 
 		 516 aa  571  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  57.83 
 
 		 528 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  56.7 
 
 		 511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  45.02 
 
 		 715 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 		 540 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  37.84 
 
 		 506 aa  345  8.999999999999999e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  40.04 
 
 		 511 aa  310  5e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  34.84 
 
 		 516 aa  290  4e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  34.07 
 
 		 504 aa  281  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  34.07 
 
 		 504 aa  281  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  35.89 
 
 		 507 aa  279  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  35.96 
 
 		 508 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  31.91 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  36.04 
 
 		 508 aa  272  9e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  38.11 
 
 		 526 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  35.63 
 
 		 567 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  36.6 
 
 		 509 aa  269  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  37.21 
 
 		 523 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  36.83 
 
 		 523 aa  266  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  36.16 
 
 		 504 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  33.13 
 
 		 502 aa  263  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  34.8 
 
 		 520 aa  263  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  38.41 
 
 		 535 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  31.41 
 
 		 509 aa  258  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  36.04 
 
 		 516 aa  256  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  36.9 
 
 		 533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  36.36 
 
 		 507 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  30.88 
 
 		 506 aa  251  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  32.04 
 
 		 507 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  32.08 
 
 		 505 aa  250  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  32.08 
 
 		 505 aa  249  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  32.08 
 
 		 505 aa  249  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  34.78 
 
 		 489 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  33.41 
 
 		 509 aa  247  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  31.68 
 
 		 505 aa  246  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  36.3 
 
 		 506 aa  244  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  31.68 
 
 		 505 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  31.49 
 
 		 505 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  31.68 
 
 		 505 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2406  histidine ammonia-lyase  34.78 
 
 		 552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  31.49 
 
 		 505 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  31.65 
 
 		 523 aa  243  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  37 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  31.29 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  33.92 
 
 		 498 aa  242  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  31.49 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  32 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  32.98 
 
 		 511 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  36.79 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0175  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 567 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  38.22 
 
 		 506 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  29.26 
 
 		 512 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  36.86 
 
 		 514 aa  240  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  37.68 
 
 		 514 aa  240  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  39.11 
 
 		 508 aa  239  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  37.07 
 
 		 507 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  31.03 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  36.65 
 
 		 507 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  36.65 
 
 		 507 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  36.65 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  36.65 
 
 		 507 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  32.18 
 
 		 497 aa  238  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  37.25 
 
 		 514 aa  237  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  36.65 
 
 		 529 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  36.65 
 
 		 507 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  36.65 
 
 		 533 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  35.15 
 
 		 518 aa  237  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  38.27 
 
 		 499 aa  237  4e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  34.44 
 
 		 530 aa  237  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  34.79 
 
 		 511 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  34.86 
 
 		 536 aa  236  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  34.37 
 
 		 512 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>