286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1421 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  69.4 
 
 
514 aa  646    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  72.6 
 
 
526 aa  660    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  71.2 
 
 
514 aa  649    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  73.48 
 
 
514 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  69.84 
 
 
534 aa  641    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
514 aa  986    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  70.4 
 
 
515 aa  627  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  69.46 
 
 
533 aa  618  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  65.35 
 
 
537 aa  600  1e-170  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  72.97 
 
 
503 aa  598  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  62.21 
 
 
530 aa  586  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  62.13 
 
 
517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  62.02 
 
 
530 aa  580  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  66.2 
 
 
517 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  65.47 
 
 
518 aa  561  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  63.76 
 
 
544 aa  560  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  58.59 
 
 
512 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  58.26 
 
 
512 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  56.12 
 
 
509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  47.98 
 
 
511 aa  410  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  43.64 
 
 
507 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  45.47 
 
 
507 aa  399  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  42.91 
 
 
516 aa  401  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  48.14 
 
 
520 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  50.71 
 
 
506 aa  395  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  44.49 
 
 
508 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  49.8 
 
 
513 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  45.58 
 
 
509 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  50.75 
 
 
508 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  50.75 
 
 
508 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  50.75 
 
 
508 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  47.64 
 
 
506 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  49.8 
 
 
499 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  46.86 
 
 
511 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  40.49 
 
 
505 aa  358  9e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  44.25 
 
 
516 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  42.8 
 
 
508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  42.55 
 
 
505 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  42.34 
 
 
505 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  42.13 
 
 
505 aa  353  5e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  39.88 
 
 
522 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  42.13 
 
 
505 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  42.34 
 
 
506 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  42.13 
 
 
505 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  42.13 
 
 
505 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  42.13 
 
 
505 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  42.34 
 
 
505 aa  350  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  42.55 
 
 
505 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  40.86 
 
 
489 aa  350  5e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  42.61 
 
 
498 aa  349  7e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  41.79 
 
 
505 aa  349  7e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  44.79 
 
 
504 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 
497 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  43.57 
 
 
511 aa  347  3e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  43.38 
 
 
507 aa  347  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  43.25 
 
 
513 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  43.2 
 
 
513 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  44.6 
 
 
514 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  43.06 
 
 
513 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  46.32 
 
 
515 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  43.06 
 
 
513 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  38.8 
 
 
523 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  42.58 
 
 
536 aa  345  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  45.24 
 
 
518 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  46.09 
 
 
517 aa  343  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  43.14 
 
 
510 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  42.8 
 
 
513 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  42.49 
 
 
512 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  42.6 
 
 
513 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 
497 aa  338  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  45.04 
 
 
518 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  44.03 
 
 
513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  42.31 
 
 
506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  43.38 
 
 
507 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  44.05 
 
 
513 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  41.38 
 
 
510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  43.58 
 
 
511 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  39.64 
 
 
504 aa  336  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  42.77 
 
 
511 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  44.27 
 
 
511 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  42.19 
 
 
513 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  42.19 
 
 
513 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  42.19 
 
 
513 aa  336  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  39.64 
 
 
504 aa  336  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  43.38 
 
 
507 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  41.11 
 
 
511 aa  336  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  45.02 
 
 
518 aa  335  9e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  38.22 
 
 
528 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  43.27 
 
 
511 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  43.86 
 
 
507 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  41.96 
 
 
506 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  41.96 
 
 
506 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  43.66 
 
 
507 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  41.96 
 
 
506 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  41.96 
 
 
506 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  42.92 
 
 
510 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  43.38 
 
 
507 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  43.53 
 
 
514 aa  332  9e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  41.34 
 
 
538 aa  332  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>