285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6266 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  70.28 
 
 		 537 aa  658    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  77.37 
 
 		 514 aa  714    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  74.8 
 
 		 534 aa  701    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  75.81 
 
 		 514 aa  729    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  74.65 
 
 		 515 aa  689    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 503 aa  980    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  72.92 
 
 		 526 aa  639    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  72.46 
 
 		 533 aa  666    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  69.66 
 
 		 517 aa  634  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  66.27 
 
 		 530 aa  627  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  66.47 
 
 		 530 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  66.67 
 
 		 544 aa  606  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  63.65 
 
 		 517 aa  600  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  70.04 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  68.75 
 
 		 518 aa  594  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  72.38 
 
 		 514 aa  591  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  60.54 
 
 		 509 aa  521  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  57.58 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  57.58 
 
 		 512 aa  510  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  49.8 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  46.69 
 
 		 509 aa  412  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 		 507 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  46.37 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  48.02 
 
 		 520 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  43.72 
 
 		 505 aa  392  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  50.21 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  42.69 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  44.38 
 
 		 507 aa  386  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  48.44 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  50.99 
 
 		 508 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  45.21 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  43.09 
 
 		 508 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  51.21 
 
 		 508 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  46.18 
 
 		 516 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  48.27 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  51.11 
 
 		 508 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  42.77 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  41.68 
 
 		 489 aa  372  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  44 
 
 		 536 aa  365  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  41.55 
 
 		 497 aa  365  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  42.57 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  43.37 
 
 		 511 aa  364  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  41.77 
 
 		 497 aa  363  4e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  42.57 
 
 		 510 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  42.18 
 
 		 510 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  43.53 
 
 		 512 aa  362  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  42.18 
 
 		 510 aa  360  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  44.56 
 
 		 514 aa  359  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  46.88 
 
 		 504 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  42.18 
 
 		 513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  42.8 
 
 		 533 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  41.98 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  39.55 
 
 		 523 aa  357  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  41.98 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  40.85 
 
 		 522 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  41.15 
 
 		 538 aa  356  5e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  41.98 
 
 		 513 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  45.08 
 
 		 526 aa  356  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  42.18 
 
 		 513 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  44.22 
 
 		 524 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  43.48 
 
 		 511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  41.78 
 
 		 513 aa  353  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  44.07 
 
 		 508 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  46.34 
 
 		 508 aa  353  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  41.39 
 
 		 513 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  41.39 
 
 		 513 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  41.39 
 
 		 513 aa  351  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  47.72 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  43.55 
 
 		 507 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  41.45 
 
 		 510 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  41.77 
 
 		 514 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  43.09 
 
 		 518 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  41.16 
 
 		 511 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 		 507 aa  346  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  42.28 
 
 		 513 aa  346  7e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  41.42 
 
 		 503 aa  344  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  42.63 
 
 		 507 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  43.2 
 
 		 511 aa  342  8e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  43.95 
 
 		 515 aa  342  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  43.4 
 
 		 515 aa  340  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  41.4 
 
 		 506 aa  339  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  40.91 
 
 		 519 aa  339  8e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  41.83 
 
 		 515 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  40.76 
 
 		 506 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  40.44 
 
 		 511 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  40.76 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  40.76 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  42.34 
 
 		 507 aa  338  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  40.76 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  44.88 
 
 		 517 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  43.12 
 
 		 507 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  40.76 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  41.62 
 
 		 510 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  44.04 
 
 		 510 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  41.62 
 
 		 510 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  44.64 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  41.68 
 
 		 514 aa  334  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  42.39 
 
 		 511 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  41.73 
 
 		 507 aa  334  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  39 
 
 		 504 aa  333  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>