286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
518 aa  1005    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  67.24 
 
 
530 aa  672    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  71 
 
 
537 aa  679    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  67.24 
 
 
530 aa  673    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  67.19 
 
 
534 aa  633  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  67.74 
 
 
514 aa  634  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  66.4 
 
 
514 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  67.99 
 
 
517 aa  614  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  66.54 
 
 
515 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  65.38 
 
 
526 aa  584  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  62.36 
 
 
544 aa  570  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  64.46 
 
 
514 aa  568  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  61.05 
 
 
533 aa  571  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  68.75 
 
 
503 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  58.49 
 
 
517 aa  552  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  65.47 
 
 
514 aa  529  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  57 
 
 
512 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  56.06 
 
 
509 aa  499  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  56.75 
 
 
512 aa  500  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  49.4 
 
 
513 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  43.44 
 
 
507 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  46.01 
 
 
507 aa  402  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  45.19 
 
 
511 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  44.64 
 
 
508 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  42.44 
 
 
516 aa  397  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  44.81 
 
 
509 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  48.18 
 
 
506 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  46.48 
 
 
520 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  41.63 
 
 
498 aa  369  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  46.41 
 
 
506 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  41.9 
 
 
505 aa  371  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  45.53 
 
 
516 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  45.95 
 
 
513 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  40.82 
 
 
523 aa  365  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  45.15 
 
 
518 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  43.46 
 
 
508 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  44.73 
 
 
515 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  42.59 
 
 
489 aa  357  1.9999999999999998e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  46.72 
 
 
517 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  42.45 
 
 
533 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  47.05 
 
 
518 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  44.36 
 
 
518 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  48.58 
 
 
499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  43.94 
 
 
511 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  44.56 
 
 
513 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  42.91 
 
 
514 aa  352  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  42.91 
 
 
511 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  46.84 
 
 
510 aa  351  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  44.35 
 
 
513 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  45.34 
 
 
507 aa  350  3e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  44.35 
 
 
513 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  44.35 
 
 
513 aa  350  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  44.35 
 
 
513 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  45.06 
 
 
514 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  44.35 
 
 
510 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  45.09 
 
 
533 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  45.09 
 
 
529 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  45.36 
 
 
507 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  45.09 
 
 
529 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  41.92 
 
 
505 aa  348  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  42.6 
 
 
506 aa  347  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  45.16 
 
 
507 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  43.94 
 
 
513 aa  346  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  45.16 
 
 
507 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  45.16 
 
 
507 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  50 
 
 
508 aa  346  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  42.18 
 
 
510 aa  346  7e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  40.61 
 
 
505 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  40.4 
 
 
505 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  40.4 
 
 
505 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  42.19 
 
 
497 aa  345  1e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  41.07 
 
 
505 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  44.2 
 
 
511 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  40.61 
 
 
505 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  50.21 
 
 
508 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  41.48 
 
 
505 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  47.05 
 
 
510 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  41.07 
 
 
506 aa  345  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  44.78 
 
 
514 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  44.53 
 
 
513 aa  344  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  40.83 
 
 
497 aa  344  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  43.92 
 
 
519 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  40.4 
 
 
505 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  43.53 
 
 
507 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  43.37 
 
 
507 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  42.2 
 
 
511 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  46.68 
 
 
510 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  42.5 
 
 
511 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1653  histidine ammonia-lyase  46.69 
 
 
513 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129126  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  40.4 
 
 
505 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  42.31 
 
 
511 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  42.72 
 
 
513 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  42.72 
 
 
513 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  42.72 
 
 
513 aa  343  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 
511 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  41.07 
 
 
505 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  43.84 
 
 
512 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  43.17 
 
 
507 aa  342  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  40.33 
 
 
522 aa  342  9e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  44.69 
 
 
512 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>