More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4111 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  78.78 
 
 
282 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  78.78 
 
 
285 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  78.78 
 
 
285 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  79.64 
 
 
285 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  79.14 
 
 
282 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  79.64 
 
 
285 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  78.42 
 
 
285 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  79.64 
 
 
285 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  79.86 
 
 
285 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  78.06 
 
 
285 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  67.05 
 
 
280 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  66.67 
 
 
280 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  66.67 
 
 
280 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  64.06 
 
 
280 aa  350  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  63.64 
 
 
280 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  64 
 
 
280 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  64.36 
 
 
280 aa  316  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  68.73 
 
 
283 aa  312  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  56 
 
 
285 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  54.91 
 
 
284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  58.03 
 
 
284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  57.14 
 
 
284 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  53.82 
 
 
284 aa  300  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  56.73 
 
 
284 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  55.36 
 
 
290 aa  291  8e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  54.84 
 
 
281 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  56.43 
 
 
289 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  55.47 
 
 
284 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  53.93 
 
 
297 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  57.09 
 
 
272 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  54.81 
 
 
284 aa  272  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  50 
 
 
282 aa  269  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  53.57 
 
 
296 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  53.57 
 
 
296 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  48.87 
 
 
275 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  51.31 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  48.4 
 
 
281 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  51.34 
 
 
275 aa  265  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  52.33 
 
 
271 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  49.08 
 
 
279 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  47.89 
 
 
279 aa  255  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  49.64 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  49.64 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  49.64 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  49.64 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  50.76 
 
 
262 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  49.22 
 
 
279 aa  249  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  52.5 
 
 
295 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  52.86 
 
 
289 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  42.75 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  40.96 
 
 
287 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  44.4 
 
 
286 aa  202  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  40.22 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  44.49 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  39.55 
 
 
285 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  44 
 
 
284 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  42.44 
 
 
288 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  37.15 
 
 
288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  44.17 
 
 
288 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  40.08 
 
 
281 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  53.45 
 
 
116 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  46.1 
 
 
161 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  35.65 
 
 
264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  30.04 
 
 
260 aa  94  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  32.49 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  29.39 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  29.06 
 
 
260 aa  89.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  34.5 
 
 
256 aa  89  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  33.67 
 
 
256 aa  89  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  32.37 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  27.93 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  29.88 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  29.08 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  30.68 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  31.25 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  28.26 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  32.1 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  29.07 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  32.16 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  31.09 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  32.16 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  32.16 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  28.92 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  27.09 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  29.02 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  30.89 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  30.43 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  29.73 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  30.52 
 
 
258 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  25.22 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  29.53 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  29.65 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  27.6 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  29.91 
 
 
259 aa  79  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  28.57 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  31.22 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  30.27 
 
 
264 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  28.14 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>