More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3024 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  100 
 
 
288 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  72.43 
 
 
288 aa  371  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  67.57 
 
 
288 aa  332  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  47.71 
 
 
275 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  50.63 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  44.44 
 
 
279 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  43.27 
 
 
279 aa  232  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  45.8 
 
 
279 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  44.09 
 
 
279 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  44.35 
 
 
275 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  42.8 
 
 
281 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  39.86 
 
 
280 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  39.86 
 
 
280 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  45.34 
 
 
287 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  43.04 
 
 
286 aa  205  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  44.12 
 
 
285 aa  204  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  42.86 
 
 
280 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  43.7 
 
 
285 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  44.77 
 
 
262 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  40.51 
 
 
285 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  39.43 
 
 
280 aa  198  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  38.41 
 
 
285 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  38.41 
 
 
285 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  38.41 
 
 
285 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  40.81 
 
 
280 aa  195  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  43.75 
 
 
282 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  44.17 
 
 
284 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  43.7 
 
 
280 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  42.91 
 
 
288 aa  192  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  39.34 
 
 
285 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  41.67 
 
 
285 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  42.92 
 
 
282 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  41.67 
 
 
285 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  41.25 
 
 
281 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  40.95 
 
 
285 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  40.07 
 
 
284 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  42.57 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  37.89 
 
 
284 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  42.5 
 
 
285 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  42.5 
 
 
285 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  40.34 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  41.7 
 
 
281 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  36.07 
 
 
284 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  41.3 
 
 
272 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  41.3 
 
 
284 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  41.07 
 
 
284 aa  175  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  46.54 
 
 
283 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  40.68 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  44.33 
 
 
284 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  41.1 
 
 
297 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  39.92 
 
 
271 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  41.1 
 
 
296 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  41.1 
 
 
296 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  39.13 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  41.1 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  42.86 
 
 
295 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  40 
 
 
285 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  40 
 
 
285 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  40 
 
 
285 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  40 
 
 
285 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  37.87 
 
 
289 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  36.63 
 
 
264 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  33.47 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  33.47 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  32.34 
 
 
261 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  37.44 
 
 
263 aa  109  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  29.39 
 
 
263 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  32.46 
 
 
260 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  30.85 
 
 
256 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  33 
 
 
256 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  33.48 
 
 
256 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  32.54 
 
 
267 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  31.13 
 
 
264 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  33.64 
 
 
267 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  31.47 
 
 
257 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  30 
 
 
266 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  30.62 
 
 
265 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  34.39 
 
 
257 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  34.36 
 
 
263 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  36.65 
 
 
250 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  33.18 
 
 
248 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  34.31 
 
 
267 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  29.03 
 
 
258 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  30.53 
 
 
250 aa  99.4  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  34.29 
 
 
270 aa  99  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  32.83 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  28.5 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  30.71 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  31.5 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  30.36 
 
 
244 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  35.38 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  35.38 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  33.51 
 
 
245 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  33.85 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  35.2 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  33.85 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  35.38 
 
 
258 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  26.44 
 
 
249 aa  96.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  32.04 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  33.15 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>