More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6633 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 279 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  77.42 
 
 		 279 aa  444  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  78.65 
 
 		 281 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  73.26 
 
 		 275 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  72.45 
 
 		 275 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  67.77 
 
 		 279 aa  381  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  65.94 
 
 		 282 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  73.18 
 
 		 262 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  64.1 
 
 		 279 aa  360  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  49.82 
 
 		 280 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  49.82 
 
 		 280 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  50.57 
 
 		 280 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  51.88 
 
 		 280 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  49.45 
 
 		 280 aa  270  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  49.45 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  53.21 
 
 		 290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  50.55 
 
 		 281 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  49.26 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  50.18 
 
 		 284 aa  265  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  50.38 
 
 		 284 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  48.35 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  49.43 
 
 		 282 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  47.99 
 
 		 285 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  47.99 
 
 		 285 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  53.01 
 
 		 297 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  48.84 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  48.84 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  48.84 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  50 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  49.62 
 
 		 284 aa  258  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  48.85 
 
 		 285 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  51.89 
 
 		 289 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  52.61 
 
 		 296 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  52.61 
 
 		 296 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  49.43 
 
 		 285 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  48.2 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  49.06 
 
 		 285 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  49.08 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  49.08 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  49.08 
 
 		 272 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  50.18 
 
 		 280 aa  242  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  46.04 
 
 		 284 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  51.15 
 
 		 284 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  51.82 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  45.45 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  43.8 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  45.42 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  50.42 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  50.84 
 
 		 288 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  56.16 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  46.33 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  46.33 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  46.33 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  41.6 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  46.33 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  46.72 
 
 		 288 aa  218  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  45.8 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  48.29 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  43.36 
 
 		 285 aa  208  9e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  40.7 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  40.49 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  33.21 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  47.79 
 
 		 116 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  39.38 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  34.62 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  29.6 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  31.02 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  32.58 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  30.61 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  31.02 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  45.93 
 
 		 161 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  32.77 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  33.19 
 
 		 264 aa  99.4  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  30.83 
 
 		 267 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  32.09 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  33.01 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.05 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  34.54 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  34.54 
 
 		 256 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  32.8 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  29.53 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  31.41 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  30.26 
 
 		 257 aa  92.8  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  36.78 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  27.06 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  27.89 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  28.69 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  27.97 
 
 		 246 aa  89.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  28.7 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  29.02 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  32.3 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  30.69 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  31.94 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  32.8 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  30.69 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  30.65 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  28.43 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  31.54 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05671  putative transporter, membrane component  29.26 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  30.14 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>