More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1129 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 275 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  73.43 
 
 		 279 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  73.26 
 
 		 279 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  71.11 
 
 		 281 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  66.55 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  64.73 
 
 		 275 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  66.3 
 
 		 282 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  60.92 
 
 		 279 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  64.89 
 
 		 262 aa  332  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  50 
 
 		 280 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  52.11 
 
 		 280 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  52.11 
 
 		 280 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  52.27 
 
 		 280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  51.29 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  48.89 
 
 		 282 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  50 
 
 		 280 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  48.15 
 
 		 285 aa  274  9e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  48.15 
 
 		 285 aa  274  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  48.15 
 
 		 285 aa  274  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  47.41 
 
 		 282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  47.41 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  49.82 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  46.3 
 
 		 285 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  46.3 
 
 		 285 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  51.87 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  51.36 
 
 		 285 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  51.14 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  50.83 
 
 		 285 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  54 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  49.42 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  46.52 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  52.92 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  48.79 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  51.66 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  45.42 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  49.03 
 
 		 284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  48.68 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  48.5 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  47.97 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  50.74 
 
 		 283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  47.86 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  48.3 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  48.3 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  49.43 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  45.62 
 
 		 288 aa  228  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  49.41 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  49.62 
 
 		 284 aa  226  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  49.04 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  49.04 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  45.85 
 
 		 285 aa  221  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  49.52 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  41 
 
 		 287 aa  218  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  55.19 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  45.85 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  44.35 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  43.7 
 
 		 285 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  43.7 
 
 		 285 aa  204  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  43.7 
 
 		 285 aa  204  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  43.7 
 
 		 285 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  48.39 
 
 		 289 aa  198  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  39.92 
 
 		 281 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  34.03 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  32.27 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  32.27 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  32.27 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  33.98 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  35.38 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  32.99 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  35 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  46.09 
 
 		 116 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  32.92 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  30.77 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  33.66 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  32.16 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  35.5 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  34.15 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  33.99 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  34.17 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  32.72 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  30.19 
 
 		 267 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  36.55 
 
 		 257 aa  95.5  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  43.61 
 
 		 161 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  31.71 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  28.97 
 
 		 247 aa  92  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  29.62 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  30.36 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  30.39 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  34.72 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  30.77 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  32.26 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  32.07 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  30.69 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  36.51 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  31.02 
 
 		 375 aa  88.6  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  32.6 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  32.64 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  27.8 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  31.63 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>