More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4347 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
282 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  71.43 
 
 
275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  66.3 
 
 
275 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  65.94 
 
 
279 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  64.54 
 
 
281 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  64.66 
 
 
279 aa  368  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  64.64 
 
 
279 aa  360  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  63.57 
 
 
279 aa  352  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  66.41 
 
 
262 aa  351  8e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  50.72 
 
 
284 aa  275  8e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  50.54 
 
 
284 aa  275  9e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  48.53 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  49.81 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  48.53 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  48.92 
 
 
285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  48.92 
 
 
285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  48.92 
 
 
285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  48.53 
 
 
282 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  48.16 
 
 
282 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  51.54 
 
 
284 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  52.53 
 
 
285 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  51.34 
 
 
280 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  50 
 
 
271 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  48.53 
 
 
280 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  50.57 
 
 
280 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  45.96 
 
 
285 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  52.09 
 
 
284 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  45.59 
 
 
285 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  49.64 
 
 
284 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  45.59 
 
 
285 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  52.92 
 
 
284 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  48.7 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  45.36 
 
 
281 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  50 
 
 
281 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  51.17 
 
 
297 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  47.01 
 
 
285 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  46.64 
 
 
285 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  47.04 
 
 
285 aa  244  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  50.78 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  46.67 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  52.71 
 
 
283 aa  242  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  50.37 
 
 
272 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  49.29 
 
 
284 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  50.78 
 
 
296 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  50.78 
 
 
296 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  46.81 
 
 
288 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  48.39 
 
 
286 aa  234  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  48.89 
 
 
280 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  50.63 
 
 
288 aa  228  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  46.49 
 
 
285 aa  228  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  46.49 
 
 
285 aa  228  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  46.49 
 
 
285 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  46.49 
 
 
285 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  50.8 
 
 
295 aa  228  9e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  43.73 
 
 
288 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  50.63 
 
 
288 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  42.32 
 
 
287 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  41.64 
 
 
285 aa  209  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  47.62 
 
 
289 aa  205  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  42.15 
 
 
284 aa  202  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  41.43 
 
 
281 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  34.59 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  33.74 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
251 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  32.73 
 
 
270 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  29.55 
 
 
256 aa  105  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  36.92 
 
 
267 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  42.86 
 
 
161 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  33.33 
 
 
386 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  34.62 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  31.35 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  34.52 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  31.95 
 
 
261 aa  95.9  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  32.8 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  33.17 
 
 
256 aa  95.9  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  34.12 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  33.17 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  30.39 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  30.65 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  31.94 
 
 
248 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  32.66 
 
 
257 aa  92.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  31.75 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  33.5 
 
 
250 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  30.77 
 
 
267 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  30.38 
 
 
257 aa  92  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  29.04 
 
 
375 aa  92  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  31.91 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  31.91 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  31.03 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  30.54 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  33.51 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  30.81 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  29.81 
 
 
380 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  32.68 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  32.84 
 
 
262 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  31.79 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  28.57 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  29.41 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>