More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2249 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 279 aa  553  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  73.43 
 
 		 275 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  67.77 
 
 		 279 aa  381  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  65.53 
 
 		 275 aa  363  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  66.92 
 
 		 281 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  61.9 
 
 		 279 aa  355  5.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  63.57 
 
 		 282 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  60.62 
 
 		 279 aa  328  8e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  62.07 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  49.45 
 
 		 280 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  49.45 
 
 		 280 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  48.72 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  48.87 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  51.95 
 
 		 284 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  47.99 
 
 		 280 aa  259  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  52 
 
 		 285 aa  258  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  47.62 
 
 		 280 aa  258  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  44.24 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  45.72 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  45.72 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  45.72 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  48.83 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  43.49 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  47.66 
 
 		 284 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  46.49 
 
 		 286 aa  242  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  45.35 
 
 		 285 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  45.35 
 
 		 285 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  45.35 
 
 		 285 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  48.13 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  49.21 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  48.12 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  48.86 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  46 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  47.06 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  48.11 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  49.45 
 
 		 280 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  50.58 
 
 		 284 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  49.06 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  47.2 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  45.08 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  48.68 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  48.68 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  47.91 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  42.41 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  43.73 
 
 		 285 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  45.45 
 
 		 284 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  51.79 
 
 		 283 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  47.04 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  43.93 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  44.09 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  45.05 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  48.73 
 
 		 288 aa  212  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  47.27 
 
 		 285 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  47.27 
 
 		 285 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  47.27 
 
 		 285 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  47.27 
 
 		 285 aa  209  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  43.48 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  43.48 
 
 		 285 aa  204  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  46.69 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  47.71 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  39.92 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  36.1 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  36.1 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  35.68 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  34.75 
 
 		 264 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  48.25 
 
 		 116 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  34.23 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  33.19 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  31.97 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  34.48 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  35.82 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  31.52 
 
 		 250 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  32.16 
 
 		 250 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.9 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  34.5 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  32.62 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  29.82 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  32.46 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  29.78 
 
 		 260 aa  96.3  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  33.5 
 
 		 267 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  29.32 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  29.03 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  29.63 
 
 		 375 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  36.08 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  35.27 
 
 		 257 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  27.56 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  33.67 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  31.1 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  32.86 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  32.89 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  31.63 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  35.6 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  31.63 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  27.71 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  31.16 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  31.71 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  31.47 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  30.88 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  32.05 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  46.62 
 
 		 161 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>