More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0117 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  584  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  584  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  97.97 
 
 
297 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  89.62 
 
 
290 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  88.54 
 
 
289 aa  471  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  77.43 
 
 
289 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  72.6 
 
 
295 aa  360  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  56.99 
 
 
285 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  56.99 
 
 
285 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  56.99 
 
 
285 aa  321  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  55.63 
 
 
285 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  55.63 
 
 
285 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  55.63 
 
 
285 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  56.99 
 
 
285 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  58.04 
 
 
285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  57.2 
 
 
282 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  54.38 
 
 
282 aa  311  9e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  58.08 
 
 
280 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  57.31 
 
 
280 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  57.31 
 
 
280 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  56.64 
 
 
285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  53.62 
 
 
284 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  53.68 
 
 
281 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  55.12 
 
 
280 aa  298  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  51.7 
 
 
284 aa  298  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  57.72 
 
 
284 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  56.25 
 
 
280 aa  295  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  56.99 
 
 
280 aa  294  9e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  50.92 
 
 
284 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  54.21 
 
 
281 aa  285  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  51.7 
 
 
279 aa  285  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  54.12 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  64.34 
 
 
283 aa  281  9e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  52.71 
 
 
271 aa  279  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  51.14 
 
 
279 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  49.81 
 
 
282 aa  272  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  48.56 
 
 
281 aa  271  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  52.72 
 
 
284 aa  268  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  49.43 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  54.61 
 
 
284 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  48.3 
 
 
275 aa  261  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  54.65 
 
 
272 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  53.41 
 
 
280 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  52.63 
 
 
285 aa  255  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  52.63 
 
 
285 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  52.63 
 
 
285 aa  255  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  52.63 
 
 
285 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  48.68 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  48.85 
 
 
279 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  49.6 
 
 
262 aa  238  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  40.94 
 
 
287 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  42.86 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  41.35 
 
 
285 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  41.11 
 
 
285 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  46.22 
 
 
288 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  38.41 
 
 
286 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  38.77 
 
 
288 aa  191  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  45.38 
 
 
288 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  40.32 
 
 
284 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  41.1 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  38.71 
 
 
281 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  31.58 
 
 
264 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  53.57 
 
 
116 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  51.83 
 
 
161 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  30.04 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  29.48 
 
 
253 aa  96.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  33 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  33.83 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  31.41 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  32.5 
 
 
251 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  31.77 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  31.75 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  31.41 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  26.77 
 
 
256 aa  89.4  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  28.43 
 
 
249 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  26.37 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  32.32 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  24.81 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  31.84 
 
 
264 aa  86.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05671  putative transporter, membrane component  27.32 
 
 
248 aa  85.9  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  31.6 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  27.95 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  28.03 
 
 
260 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  29.84 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  31.64 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  27.27 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  30.6 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  31.82 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  29.35 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  30.41 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  30.36 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  29.9 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5158  protein of unknown function DUF140  31.98 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  29.57 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  29.47 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  30.89 
 
 
270 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  31.94 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  32.65 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  24.81 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  26.64 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>