More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0702 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  541  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  71.43 
 
 		 282 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  72.45 
 
 		 279 aa  404  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  71.43 
 
 		 281 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  66.55 
 
 		 279 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  64.73 
 
 		 275 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  66.31 
 
 		 279 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  65.53 
 
 		 279 aa  363  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  68.58 
 
 		 262 aa  358  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  51.34 
 
 		 280 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  51.34 
 
 		 280 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  51.34 
 
 		 280 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  50.57 
 
 		 280 aa  275  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  50.18 
 
 		 280 aa  275  8e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  48.16 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  49.25 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  46.45 
 
 		 282 aa  268  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  46.99 
 
 		 285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  46.99 
 
 		 285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  46.24 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  47.06 
 
 		 284 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  48.85 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  50.19 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  47.69 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  47.67 
 
 		 285 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  55.23 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  47.89 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  49.8 
 
 		 286 aa  249  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  49.81 
 
 		 290 aa  248  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  48.2 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  50.92 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  46.99 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  55.38 
 
 		 283 aa  245  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  46.62 
 
 		 285 aa  244  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  51.85 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  49.23 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  52.3 
 
 		 288 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  45.96 
 
 		 285 aa  238  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  43.98 
 
 		 287 aa  236  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  46.51 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  51.44 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  51.44 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  48.66 
 
 		 272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  48.66 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  48.29 
 
 		 289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  46.92 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  48.85 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  47.71 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  46.49 
 
 		 288 aa  225  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  50 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  43.85 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  44.79 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  44.79 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  44.79 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  44.79 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  41.86 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  41.6 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  46.74 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  33.46 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  46.55 
 
 		 116 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  32.44 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  32.18 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  33.98 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  30.2 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  30.2 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  29.8 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  27.27 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  32.58 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  34.15 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  28.96 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  33.5 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  27.31 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.63 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  32.34 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  33.51 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  32.31 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  29.5 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  30.88 
 
 		 250 aa  90.1  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  29.12 
 
 		 312 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  28.92 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  43.7 
 
 		 161 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  28.7 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  30.65 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  30.15 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  28.4 
 
 		 264 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  26.89 
 
 		 380 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  33.84 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  28.06 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  28.06 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  30.73 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  29.55 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  29.06 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  24.9 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  29.89 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  29.89 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  32.18 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  29.8 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>