More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4171 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 285 aa  560  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  58.19 
 
 		 287 aa  345  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  55.89 
 
 		 284 aa  285  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  47.12 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  46.4 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  48.91 
 
 		 281 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  43.97 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  43.48 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  43.38 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  45.85 
 
 		 275 aa  221  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  43.85 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  43.92 
 
 		 285 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  44.31 
 
 		 285 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  44.31 
 
 		 285 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  42.48 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  42.48 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  42.48 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  42.75 
 
 		 279 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  42.86 
 
 		 279 aa  214  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  41.35 
 
 		 280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  42.03 
 
 		 281 aa  212  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  40.98 
 
 		 280 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  40.98 
 
 		 280 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  37.28 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  41.64 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  43.36 
 
 		 279 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  43.54 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  42.44 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  43.48 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  41.49 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  43.22 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  43.14 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  42.57 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  44.78 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  42.91 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  40.51 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  41.7 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  42.13 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  42.86 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  42.86 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  39.03 
 
 		 284 aa  189  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  41.76 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  40.32 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  40.37 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  41.11 
 
 		 271 aa  185  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  39.1 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  44.35 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  41.7 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  38.25 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  40 
 
 		 284 aa  178  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  41.76 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  40.61 
 
 		 280 aa  169  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  43.97 
 
 		 284 aa  168  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  42.28 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  43.6 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  37.94 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  36.53 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  36.53 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  36.53 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  36.53 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  38.07 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  30.59 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  34.48 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  32.09 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  28.99 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  30.68 
 
 		 328 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  32.2 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  33.17 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  31.01 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  30.09 
 
 		 264 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  30.95 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  31.9 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  34.98 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  31.58 
 
 		 267 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  31.19 
 
 		 265 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  30.54 
 
 		 265 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  36.14 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  35.4 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  30.65 
 
 		 251 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  34.02 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  32.09 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  30.15 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  31.92 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  31.25 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  31.5 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  30.15 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  34.81 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  29.03 
 
 		 255 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  32.2 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  32.2 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  26.96 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  31.46 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  31.82 
 
 		 375 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  30.2 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  30.23 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  27.75 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  28.1 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  28.1 
 
 		 261 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>