More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0712 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  89.97 
 
 
297 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  93.06 
 
 
289 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  89.62 
 
 
296 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  89.62 
 
 
296 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  80.56 
 
 
289 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  73.01 
 
 
295 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  55.02 
 
 
285 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  55.02 
 
 
285 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  55.02 
 
 
285 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  56.99 
 
 
285 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  54.55 
 
 
285 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  54.55 
 
 
285 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  54.96 
 
 
282 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  54.55 
 
 
285 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  53.87 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  57.69 
 
 
285 aa  308  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  57.34 
 
 
285 aa  305  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  55.3 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  54.92 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  55.3 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  55.51 
 
 
281 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  56.15 
 
 
284 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  53.07 
 
 
280 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  52.31 
 
 
284 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  52.36 
 
 
284 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  55.73 
 
 
280 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  55.36 
 
 
281 aa  289  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  55.34 
 
 
280 aa  288  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  55.59 
 
 
284 aa  288  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  54.29 
 
 
284 aa  284  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  53.21 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  62.6 
 
 
283 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  50.37 
 
 
279 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  52.71 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  51.98 
 
 
281 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  48.7 
 
 
282 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  49.81 
 
 
275 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  53.57 
 
 
284 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  54.48 
 
 
284 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  56.54 
 
 
272 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  48.5 
 
 
275 aa  255  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  52.33 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  48.86 
 
 
279 aa  251  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  49.23 
 
 
279 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  51.6 
 
 
285 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  51.6 
 
 
285 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  51.6 
 
 
285 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  51.6 
 
 
285 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  51.19 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  42.28 
 
 
287 aa  228  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  41.49 
 
 
285 aa  212  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  42.16 
 
 
285 aa  208  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  41.11 
 
 
285 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  45.8 
 
 
288 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  38.6 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  41.5 
 
 
284 aa  185  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  46.19 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  40.68 
 
 
288 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  36.59 
 
 
288 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  36.33 
 
 
281 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  52.68 
 
 
116 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  31.94 
 
 
264 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  50.62 
 
 
161 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  30.8 
 
 
253 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  33 
 
 
251 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  33.51 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
251 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  32.24 
 
 
261 aa  89.7  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  32.5 
 
 
251 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  28.09 
 
 
256 aa  89.4  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  29.2 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  31.38 
 
 
267 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  28.12 
 
 
267 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  29.08 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  33.13 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  31.18 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  31.38 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  29.47 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  32.58 
 
 
349 aa  82.4  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  32.16 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  31.18 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  27.62 
 
 
260 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  30.05 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  25.19 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  28.95 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  29.94 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  28.26 
 
 
260 aa  79  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  29.02 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  28.02 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  30.43 
 
 
257 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  30.91 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  32.95 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  30.15 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  31.01 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05671  putative transporter, membrane component  27.46 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  32.96 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  30.6 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  32.96 
 
 
264 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  35.2 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>