More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11996 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  100 
 
 		 271 aa  533  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  72.76 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  73.46 
 
 		 284 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  62.98 
 
 		 284 aa  342  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  59.7 
 
 		 285 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  64.66 
 
 		 284 aa  323  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  62.12 
 
 		 284 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  59.93 
 
 		 281 aa  315  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  64.86 
 
 		 272 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  64.86 
 
 		 284 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  59.32 
 
 		 284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  49.64 
 
 		 285 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  49.64 
 
 		 285 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  49.64 
 
 		 285 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  51.74 
 
 		 280 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  51.74 
 
 		 280 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  51.74 
 
 		 280 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  49.05 
 
 		 282 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  57.25 
 
 		 285 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  57.25 
 
 		 285 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  57.25 
 
 		 285 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  57.25 
 
 		 285 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  47.91 
 
 		 285 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  47.91 
 
 		 285 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  48.29 
 
 		 285 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  49.81 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  51.56 
 
 		 280 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  50 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  50.19 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  50 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  49.81 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  54 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  52.71 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  50.19 
 
 		 280 aa  256  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  50.58 
 
 		 280 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  50.19 
 
 		 275 aa  255  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  53.1 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  47.88 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  53.91 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  52.33 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  47.88 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  52.71 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  52.71 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  53.82 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  48.13 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  47.04 
 
 		 279 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  49.81 
 
 		 262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  53.88 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  49.42 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  52.71 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  41.11 
 
 		 287 aa  201  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  40.93 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  40.15 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  40.16 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  41.11 
 
 		 285 aa  185  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  46.22 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  42.02 
 
 		 288 aa  178  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  43.63 
 
 		 288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  40.55 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  41.4 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  35.02 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  56.52 
 
 		 116 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  55.4 
 
 		 161 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  32.62 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  32.37 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  26.69 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  32.44 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  31.82 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  31.82 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  32.46 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  31.64 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  31.82 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  29.37 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  32.23 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  30.53 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  32.02 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  29.17 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  25.62 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  28.16 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  27.63 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5158  protein of unknown function DUF140  32.55 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  36.36 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1033  hypothetical protein  28.38 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000157108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  31.89 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  29.06 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  30.62 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  29.61 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07665  hypothetical protein  28.7 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232914  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  27.62 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  29 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  31.1 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1553  protein of unknown function DUF140  28.57 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00323252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3703  hypothetical protein  29.23 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  30.77 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  28.93 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  33.48 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  28.19 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  30.39 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  28.5 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>