More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3790 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  53.9 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  56.6 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  51.94 
 
 		 287 aa  289  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  47.37 
 
 		 285 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  44.56 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  44.96 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  45.85 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  43.51 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  40.75 
 
 		 286 aa  228  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  41.86 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  42.91 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  42.59 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  42.35 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  40.22 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  42.21 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  42.21 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  40.29 
 
 		 279 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  42.22 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  41.98 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  40.98 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  40.89 
 
 		 282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  39.44 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  39.44 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  39.44 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  41.57 
 
 		 280 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  41.57 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  41.47 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  42 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  37.68 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  43.28 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  38.11 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  41.42 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  37.32 
 
 		 285 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  37.32 
 
 		 285 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  40.79 
 
 		 285 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  39.93 
 
 		 284 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  38.41 
 
 		 297 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  43.64 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  40.15 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  38.57 
 
 		 281 aa  191  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  43.28 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  38.28 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  38.28 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  40.79 
 
 		 289 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  40.55 
 
 		 271 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  37.1 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  39.06 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  40.21 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  36.5 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  42.52 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  40.61 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  43.6 
 
 		 283 aa  175  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  40.99 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  38.61 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  38.37 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  38.37 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  38.37 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  38.37 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  37.09 
 
 		 284 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  36.9 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  38.29 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  32.86 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  30.96 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  29.56 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  31.95 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  34 
 
 		 253 aa  92.8  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  33.73 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  27.09 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  31.47 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  33.16 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  33.14 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 251 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  32.7 
 
 		 250 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  33.5 
 
 		 256 aa  89  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  28.92 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 251 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  33.71 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  31 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  27.89 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  29.26 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  28.92 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  30.39 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  33.49 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  30.39 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  29.5 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  30.84 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  31.58 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  31.58 
 
 		 255 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  28.71 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  31.37 
 
 		 267 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  29.7 
 
 		 266 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  27.94 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  27.38 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2412  hypothetical protein  30.04 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.819451  normal  0.102751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  29.21 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  32.66 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>