More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09370 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  100 
 
 		 281 aa  554  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  78.65 
 
 		 279 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  71.9 
 
 		 279 aa  418  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  71.43 
 
 		 275 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  71.11 
 
 		 275 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  64.54 
 
 		 282 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  66.92 
 
 		 279 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  70.5 
 
 		 262 aa  358  8e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  62.78 
 
 		 279 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  50.57 
 
 		 280 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  50.19 
 
 		 280 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  50.19 
 
 		 280 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  50 
 
 		 280 aa  275  9e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  51.34 
 
 		 280 aa  268  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  50.57 
 
 		 280 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  47.62 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  47.62 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  47.62 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  47.1 
 
 		 282 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  48.88 
 
 		 282 aa  262  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  46.89 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  46.89 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  46.52 
 
 		 285 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  49.26 
 
 		 285 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  51.98 
 
 		 290 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  50.37 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  48.06 
 
 		 285 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  50.38 
 
 		 284 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  48.46 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  47.35 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  48.4 
 
 		 281 aa  251  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  48.85 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  48.68 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  51.98 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  49.08 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  46.18 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  47.88 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  53.85 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  48.68 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  48.68 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  50.96 
 
 		 280 aa  234  9e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  44.13 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  46.07 
 
 		 285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  48.85 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  48.55 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  48.19 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  50 
 
 		 284 aa  228  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  49.79 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  50.79 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  45.1 
 
 		 288 aa  218  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  42.15 
 
 		 287 aa  217  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  46.36 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  42.03 
 
 		 285 aa  212  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  44.49 
 
 		 284 aa  211  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  42.8 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  48.02 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  42.09 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  42.09 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  42.09 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  42.09 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  36.55 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  31.94 
 
 		 264 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  31.47 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  31.47 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  31.47 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  37.6 
 
 		 328 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  46.02 
 
 		 116 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  34.56 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  29.51 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  31.73 
 
 		 256 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.76 
 
 		 256 aa  99.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  31.91 
 
 		 267 aa  99  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  32.64 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  29.76 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  32.27 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  30.52 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  28.79 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  31.39 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  30.28 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  27.06 
 
 		 247 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  30.56 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  27.76 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  29.8 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  30.08 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  30.08 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  30.71 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  39.61 
 
 		 161 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  28.51 
 
 		 312 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  27.78 
 
 		 250 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  28.12 
 
 		 257 aa  89  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  27.27 
 
 		 250 aa  89  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  29.96 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  31.58 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  31.58 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  31.98 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  30.93 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  31.89 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  28.12 
 
 		 386 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  26.13 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  29.57 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>