More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1546 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  99.63 
 
 
272 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  74.65 
 
 
284 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  70.77 
 
 
284 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  69.72 
 
 
284 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  69.72 
 
 
284 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  72.18 
 
 
284 aa  391  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  66.55 
 
 
281 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  67.87 
 
 
285 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  69.01 
 
 
284 aa  361  9e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  64.86 
 
 
271 aa  346  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  56.88 
 
 
282 aa  332  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  59.41 
 
 
280 aa  331  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  57.97 
 
 
282 aa  331  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  59.41 
 
 
280 aa  331  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  59.04 
 
 
280 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  56.93 
 
 
285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  56.93 
 
 
285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  56.93 
 
 
285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  56.57 
 
 
285 aa  324  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  56.57 
 
 
285 aa  324  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  56.57 
 
 
285 aa  324  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  58.45 
 
 
280 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  56.47 
 
 
285 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  57.39 
 
 
280 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  57.04 
 
 
280 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  56.2 
 
 
285 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  58.95 
 
 
285 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  58.95 
 
 
285 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  58.95 
 
 
285 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  58.95 
 
 
285 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  55.47 
 
 
281 aa  293  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  59.21 
 
 
280 aa  285  9e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  54.48 
 
 
290 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  59.14 
 
 
283 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  49.29 
 
 
282 aa  271  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  49.08 
 
 
279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  54.98 
 
 
297 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  48.66 
 
 
275 aa  261  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  53.57 
 
 
289 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  48.28 
 
 
279 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  48.55 
 
 
281 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  52.87 
 
 
262 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  54.61 
 
 
296 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  54.61 
 
 
296 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  45.63 
 
 
279 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  49.04 
 
 
275 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  45.45 
 
 
279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  50.53 
 
 
289 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  49.82 
 
 
295 aa  225  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  36.97 
 
 
287 aa  201  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  41.7 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  43.03 
 
 
288 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  41.3 
 
 
288 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  38.91 
 
 
286 aa  185  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  43.69 
 
 
288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  37.5 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  36.69 
 
 
285 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  33.93 
 
 
281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  38.43 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  35.79 
 
 
288 aa  159  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  62.93 
 
 
116 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  54.66 
 
 
161 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  32.66 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  34.64 
 
 
264 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  31.76 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  31.64 
 
 
260 aa  89.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  30.52 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  30.64 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1694  protein of unknown function DUF140  35.05 
 
 
264 aa  87.4  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  27.63 
 
 
270 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  30.09 
 
 
264 aa  85.5  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  27.72 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  32.09 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0480  putative ABC transport system permease protein  29.17 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.192748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  27.62 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  30.48 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  29.67 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  35.19 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  33.97 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  32.47 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  29.9 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  28.85 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  28.37 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  29.44 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  27.44 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  28.81 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  29.35 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  30.6 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  32.26 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  27.44 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  27.52 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  29.47 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  31.89 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  30.05 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  35.12 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  30.54 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  30.63 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  29.11 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  28.5 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>