More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1245 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 287 aa  570  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  58.19 
 
 		 285 aa  345  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  48.12 
 
 		 285 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  51.94 
 
 		 284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  49.82 
 
 		 281 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  44.06 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  43.98 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  40.79 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  42.32 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  41.6 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  42.28 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  42.41 
 
 		 279 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  41 
 
 		 275 aa  218  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  42.15 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  43.08 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  39.33 
 
 		 282 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  41.6 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  39.62 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  39.62 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  38.58 
 
 		 282 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  40.68 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  39.62 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  40.7 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  41.22 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  40.31 
 
 		 285 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  40.31 
 
 		 285 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  40.16 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  40.16 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  40.16 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  40.31 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  45.61 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  40.08 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  38.3 
 
 		 284 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  36.61 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  41.06 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  41.06 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  41.11 
 
 		 271 aa  201  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  39.92 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  40.3 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  42.47 
 
 		 262 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  40.46 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  40.94 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  45.34 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  35.66 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  38.85 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  38.85 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  47.52 
 
 		 288 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  37.55 
 
 		 280 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  40.79 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  38.46 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  38.17 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  36.97 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  40.07 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  39.62 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  39.53 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  40.15 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  36.92 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  36.92 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  36.92 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  36.92 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  35.43 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  31.86 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  28.57 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  28.7 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  29.44 
 
 		 375 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  29.29 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  30.98 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  27.31 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  26.69 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  37.82 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  27.82 
 
 		 258 aa  95.5  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  26.29 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  26.29 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  30.62 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  27.8 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  31.41 
 
 		 349 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  26.33 
 
 		 386 aa  93.6  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  32 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  28.4 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  31.41 
 
 		 256 aa  92  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  30.84 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  26.42 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  28.22 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  29.19 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  28.22 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  29.44 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  31.13 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  27.44 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  30.1 
 
 		 256 aa  89.7  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  30.41 
 
 		 258 aa  89.4  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  35.58 
 
 		 246 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  31.12 
 
 		 250 aa  89  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  30.95 
 
 		 265 aa  89  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  30.29 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  28.86 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  30 
 
 		 382 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  30.35 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  32.65 
 
 		 376 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  29.74 
 
 		 382 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>