More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4618 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  98.21 
 
 
280 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  91.79 
 
 
280 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  92.14 
 
 
280 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  87.5 
 
 
280 aa  443  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  76.79 
 
 
280 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  66.3 
 
 
282 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  68.94 
 
 
282 aa  364  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  67.05 
 
 
285 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  67.05 
 
 
285 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  67.05 
 
 
285 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  64.84 
 
 
285 aa  354  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  64.84 
 
 
285 aa  354  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  64.1 
 
 
285 aa  351  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  65.2 
 
 
285 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  67.44 
 
 
285 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  72.31 
 
 
283 aa  331  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  66.67 
 
 
281 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  60.15 
 
 
285 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  62.04 
 
 
284 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  56.04 
 
 
284 aa  318  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  56.88 
 
 
284 aa  318  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  56.57 
 
 
281 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  57.35 
 
 
284 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  61.15 
 
 
284 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  59.41 
 
 
272 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  59.41 
 
 
284 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  60.29 
 
 
284 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  51.34 
 
 
275 aa  292  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  52.11 
 
 
275 aa  289  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  55.3 
 
 
290 aa  287  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  49.82 
 
 
279 aa  285  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  49.81 
 
 
279 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  50.19 
 
 
281 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  49.45 
 
 
279 aa  279  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  57.69 
 
 
297 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  51.74 
 
 
271 aa  275  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  48.53 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  54.62 
 
 
289 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  54.05 
 
 
262 aa  271  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  46.95 
 
 
279 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  57.31 
 
 
296 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  57.31 
 
 
296 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  50 
 
 
285 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  50 
 
 
285 aa  247  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  50 
 
 
285 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  50 
 
 
285 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  51.64 
 
 
289 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  54.58 
 
 
295 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  41.09 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  40.98 
 
 
285 aa  211  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  47.06 
 
 
288 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  39.62 
 
 
287 aa  208  9e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  42.21 
 
 
284 aa  205  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  39.86 
 
 
288 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  37.41 
 
 
285 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  37.27 
 
 
285 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  42.37 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  47.26 
 
 
288 aa  188  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  37.41 
 
 
281 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  48.28 
 
 
116 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  33.06 
 
 
264 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  48.59 
 
 
161 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  30.83 
 
 
251 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  30.83 
 
 
251 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  30.83 
 
 
251 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  29.91 
 
 
328 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  31.35 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  28.14 
 
 
247 aa  86.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  30.05 
 
 
246 aa  86.7  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  28.57 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  29.61 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  29.03 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  26.43 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  31.4 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  28.87 
 
 
256 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  34.15 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  35.52 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  31.16 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  32.5 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  32.61 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  25.97 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  28.9 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  30.29 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  29.07 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  27.27 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  29.03 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0480  putative ABC transport system permease protein  30.37 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.192748  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  30.11 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  29.8 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  32.04 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  25.74 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  29.52 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  28.35 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  30.11 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  29.95 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  29.02 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  28.88 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17511  putative transporter, membrane component  26.53 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>